
回歸預(yù)測(cè)及R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)Part2回歸R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)
下面是回歸分析的各種變體的簡(jiǎn)單介紹,解釋變量和相應(yīng)變量就是指自變量和因變量。
常用普通最小二乘(OLS)回歸法來(lái)擬合實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單線性、多項(xiàng)式和多元線性等回歸模型。最小二乘法的基本原理前面已經(jīng)說(shuō)明了,使得預(yù)測(cè)值和觀察值之差最小。
R中實(shí)現(xiàn)擬合線性模型最基本的函數(shù)是lm(),應(yīng)用格式為:
myfit <- lm(Y~X1+X2+…+Xk,data)
data為觀測(cè)數(shù)據(jù),應(yīng)該為一個(gè)data.frame,前面是擬合表達(dá)式,Y是因變量,X1-Xk是自變量,+用來(lái)分隔不同的自變量的,還有可能用到的其他符號(hào)的說(shuō)明如下:
另外,對(duì)lm()方法的返回結(jié)果,還有一系列的分析方法,如下:
簡(jiǎn)單線性回歸
基礎(chǔ)安裝數(shù)據(jù)women中提供了15個(gè)年齡在30-39歲之前的女性的身高和體重信息,這里用身高來(lái)預(yù)測(cè)體重,來(lái)嘗試lm()方法
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par(ask = TRUE)
opar <- par(no.readonly = TRUE)
fit <- lm(weight ~ height, data = women)
summary(fit)
women$weight
fitted(fit)
residuals(fit)
plot(women$height, women$weight, main = "30-39的女性",xlab = "身高(英尺)", ylab = "體重(鎊)")#觀測(cè)數(shù)據(jù)散點(diǎn)圖
abline(fit)#擬合線
由summary(fit)的結(jié)果coefficients可看出,預(yù)測(cè)模型為:weight=-81.52+3.45*height。
因?yàn)樯砀卟豢赡転?,你沒(méi)必要給截距項(xiàng)一個(gè)物理解釋,它僅僅是一個(gè)常量調(diào)整項(xiàng)。在Pr(>|t|)欄,可以看到回歸系數(shù)(3.45)顯著(p<0.001),表明身高每增高1英寸,體重將預(yù)期增加3.45磅??蓻Q系數(shù)-R平方項(xiàng)(0.991)表明模型可以解釋體重99.1%的方差,它也是實(shí)際和預(yù)測(cè)值之間的相關(guān)系數(shù)的平方值。殘差標(biāo)準(zhǔn)誤差(1.53 lbs)則可認(rèn)為是模型用身高預(yù)測(cè)體重的平均誤差。F統(tǒng)計(jì)量檢驗(yàn)所有的預(yù)測(cè)變量預(yù)測(cè)響應(yīng)變量是否都在某個(gè)幾率水平之上。由于簡(jiǎn)單回歸只有一個(gè)預(yù)測(cè)變量,此處F檢驗(yàn)等同于身高回歸系數(shù)的t檢驗(yàn)。
多項(xiàng)式回歸
從上面例子最后的圖可以看出,我們可以為回歸模型增加一個(gè)X平方項(xiàng)來(lái)增加預(yù)測(cè)精確度。
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fit2 <- lm(weight ~ height + I(height^2), data = women)
summary(fit2)
plot(women$height, women$weight, main = "30-39的女性",xlab = "身高(英尺)", ylab = "體重(鎊)")#觀測(cè)數(shù)據(jù)散點(diǎn)圖
lines(women$height, fitted(fit2))
由summary(fit2)的結(jié)果coefficients可看出,預(yù)測(cè)模型為:weight=261.88-7.35*height+0.083* height* height。在p<0.001水平下,回歸系數(shù)都非常顯著。模型的方差解釋率已經(jīng)增加到了99.9%。二次項(xiàng)的顯著性(t = 13.89,p<0.001)表明包含二次項(xiàng)提高了模型的擬合度。從圖中也能看出來(lái),預(yù)測(cè)值和觀測(cè)值的擬合程度更好了。
介紹下car包中的scatterplot()函數(shù),它可以很容易、方便地繪制二元關(guān)系圖。
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library(car)
scatterplot(weight ~ height, data = women,spread = FALSE, lty.smooth = 2, pch = 19, main ="30-39的女性", xlab = "身高(英尺)", ylab = "體重(鎊)")
如上,是scatterplot()對(duì)women數(shù)據(jù)所繪的身高與體重的散點(diǎn)圖。直線為線性擬合,虛線為曲線平滑擬合,邊界為箱線圖。
多元線性回歸
這里以基礎(chǔ)包中的state.x77數(shù)據(jù)集為例,探究一個(gè)州的犯罪率和其他因素的關(guān)系,包括人口、文盲率、平均收入和結(jié)霜天數(shù)(溫度在冰點(diǎn)以下的平均天數(shù))。
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states <- as.data.frame(state.x77[, c("Murder","Population", "Illiteracy", "Income","Frost")])
colnames(states) <- c("謀殺率", "人口","文盲率", "收入水平", "結(jié)霜天數(shù)")
cor(states)
library(car)
scatterplotMatrix(states, spread = FALSE, main = "ScatterplotMatrix")
cor()函數(shù)顯示兩個(gè)變量之間的相關(guān)系數(shù),從圖中可以看到,謀殺率是雙峰的曲線,每個(gè)預(yù)測(cè)變量都一定程度上出現(xiàn)了偏斜。謀殺率隨著人口和文盲率的增加而增加,隨著收入水平和結(jié)霜天數(shù)增加而下降。同時(shí),越冷的州文盲率越低,收入水平越高。
下面對(duì)states數(shù)據(jù)做多項(xiàng)線性擬合,看人口、文盲率、收入水平、結(jié)霜天數(shù)對(duì)謀殺率的影響水平。
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colnames(states) <- c("Murder", "Population","Illiteracy", "Income", "Frost")
fit <- lm(Murder ~ Population + Illiteracy + Income + Frost, data= states)
summary(fit)
從結(jié)果可以看出,文盲率和人口的系數(shù)是顯著的,結(jié)霜率和收入水平系數(shù)不顯著,這兩者對(duì)謀殺率的影響不是線性的。
上面的例子是自變量之間相互獨(dú)立的,下面看一個(gè)有交互項(xiàng)的多元線性回歸的案例。同樣是R中的基礎(chǔ)安裝數(shù)據(jù)mtcars,
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fit <- lm(mpg ~ hp + wt + hp:wt, data = mtcars)
summary(fit)
從summary(fit)的Pr(>|t|)欄中能看出,hp:wt項(xiàng)是顯著的,說(shuō)明汽車(chē)的馬力和車(chē)重不是相互獨(dú)立的,兩者對(duì)每英里的耗油量的影響也都是顯著的。
汽車(chē)每英里耗油量mpg的模型為mpg =49.81 + 0.12×hp + 8.22×wt + 0.03×hp×wt。
effects包可以用來(lái)分析不同wt下,mpg與hp之間的線性關(guān)系。如下,圖中能看出,當(dāng)wt分別為2.2,3.2,4.2時(shí)mpg與hp之間的線性關(guān)系,差異還是很明顯的。
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library(effects)
plot(effect("hp:wt", fit, xlevels= list(wt = c(2.2, 3.2,4.2))), multiline = TRUE)
回歸診斷
summary()方法能獲取模型的參數(shù)和相關(guān)統(tǒng)計(jì)量,要進(jìn)一步診斷模型是否合適,還需要另外的工作。
R中有許多檢驗(yàn)回歸分析中統(tǒng)計(jì)假設(shè)的方法。plot()方法可以生成評(píng)價(jià)模型擬合情況的四幅圖形。用women數(shù)據(jù)集的回歸模型為例:
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fit <- lm(weight ~ height, data = women)
par(mfrow = c(2, 2))
plot(fit)
par(opar)
OLS回歸的統(tǒng)計(jì)假設(shè)。(擔(dān)心我自己的理解有偏誤,所以這里的解讀全部摘抄自R語(yǔ)言實(shí)戰(zhàn)?。?
正態(tài)性當(dāng)預(yù)測(cè)變量值固定時(shí),因變量成正態(tài)分布,則殘差值也應(yīng)該是一個(gè)均值為0的正態(tài)分布。正態(tài)Q-Q圖(Normal Q-Q,右上)是在正態(tài)分布對(duì)應(yīng)的值下,標(biāo)準(zhǔn)化殘差的概率圖。若滿足正態(tài)假設(shè),那么圖上的點(diǎn)應(yīng)該落在呈45度角的直線上;若不是如此,那么就違反了正態(tài)性的假設(shè)。
獨(dú)立性你無(wú)法從這些圖中分辨出因變量值是否相互獨(dú)立,只能從收集的數(shù)據(jù)中來(lái)驗(yàn)證。上面的例子中,沒(méi)有任何先驗(yàn)的理由去相信一位女性的體重會(huì)影響另外一位女性的體重。假若你發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)是從一個(gè)家庭抽樣得來(lái)的,那么可能必須要調(diào)整模型獨(dú)立性的假設(shè)。
線性若因變量與自變量線性相關(guān),那么殘差值與預(yù)測(cè)(擬合)值就沒(méi)有任何系統(tǒng)關(guān)聯(lián)。換句話說(shuō),除了白噪聲,模型應(yīng)該包含數(shù)據(jù)中所有的系統(tǒng)方差。在“殘差圖與擬合圖”(Residuals vs Fitted,左上)中可以清楚的看到一個(gè)曲線關(guān)系,這暗示著你可能需要對(duì)回歸模型加上一個(gè)二次項(xiàng)。
同方差性若滿足不變方差假設(shè),那么在位置尺度圖(Scale-Location Graph,左下)中,水平線周?chē)狞c(diǎn)應(yīng)該隨機(jī)分布。該圖似乎滿足此假設(shè)。
最后一幅“殘差與杠桿圖”(Residualsvs Leverage,右下)提供了你可能需要關(guān)注的單個(gè)觀測(cè)點(diǎn)的信息。從圖形可以鑒別出離群點(diǎn)、高杠桿值點(diǎn)和強(qiáng)影響點(diǎn)。
一個(gè)觀測(cè)點(diǎn)是離群點(diǎn),表明擬合回歸模型對(duì)其預(yù)測(cè)效果不佳(產(chǎn)生了巨大的或正或負(fù)的殘差)。
一個(gè)觀測(cè)點(diǎn)有很高的杠桿值,表明它是一個(gè)異常的預(yù)測(cè)變量值的組合。也就是說(shuō),在預(yù)測(cè)變量空間中,它是一個(gè)離群點(diǎn)。因變量值不參與計(jì)算一個(gè)觀測(cè)點(diǎn)的杠桿值。
一個(gè)觀測(cè)點(diǎn)是強(qiáng)影響點(diǎn)(influentialobservation),表明它對(duì)模型參數(shù)的估計(jì)產(chǎn)生的影響過(guò)大,非常不成比例。強(qiáng)影響點(diǎn)可以通過(guò)Cook距離即Cook’s D統(tǒng)計(jì)量來(lái)鑒別。
再來(lái)看二次擬合的診斷圖。
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newfit <- lm(weight ~ height + I(height^2), data = women)
par(mfrow = c(2, 2))
plot(newfit)
par(opar)
圖中有兩個(gè)比較明顯的離群點(diǎn),12和15,可以刪除這兩個(gè)點(diǎn)后再做回歸,效果會(huì)更好。
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newfit <- lm(weight ~ height + I(height^2), data = women[-c(13,15),])
par(mfrow = c(2, 2))
plot(newfit)
par(opar)
另外car包中提供了許多方法可以增強(qiáng)擬合和評(píng)價(jià)回歸模型的能力,如下圖,不再細(xì)說(shuō):
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