
寫在前面
R已經(jīng)成為當(dāng)前國際學(xué)術(shù)界最流行的統(tǒng)計(jì)和繪圖軟件之一,該語言較為簡單易學(xué),統(tǒng)計(jì)分析功能強(qiáng)大,且具有很強(qiáng)的繪圖功能,能夠繪制學(xué)術(shù)出版要求的多種圖表.R語言在生物信息學(xué),進(jìn)化生物學(xué)、生態(tài)學(xué)與環(huán)境、經(jīng)濟(jì)學(xué)、語言學(xué)等領(lǐng)域有著極為廣泛的應(yīng)用。
R軟件是跨平臺(tái)的,可以在Linux, MacOs, Windows等多種系統(tǒng)上運(yùn)行。針對每個(gè)研究方向,有大量的科研人員編寫了相關(guān)的程序包,可以導(dǎo)入到基本的程序平臺(tái)上運(yùn)行?,F(xiàn)有的程序包已經(jīng)超過了1800個(gè),并且還在增加中。
不僅如此,R是完全免費(fèi)的,而且全部代碼是公開的。
學(xué)習(xí)并掌握R語言,對于需要用到統(tǒng)計(jì)學(xué)的研究人員和學(xué)生都是非常必要的。
這里選取了R語言中若干操作實(shí)例,所有的命令行均可以在R中運(yùn)行,并得到結(jié)果。
正態(tài)總體均值的假設(shè)檢驗(yàn)
t檢驗(yàn)
單個(gè)總體
例一
某種元件的壽命X(小時(shí)),服從正態(tài)分布,N(mu,sigma^2),其中mu,sigma^2均未知,16只元件的壽命如下:問是否有理由認(rèn)為元件的平均壽命大于255小時(shí)。
命令:
X<-c(159, 280, 101, 212, 224, 379, 179, 264,
222, 362, 168, 250, 149, 260, 485, 170)
t.test(X, alternative = "greater", mu = 225)
兩個(gè)總體
例二
X為舊煉鋼爐出爐率,Y為新煉鋼爐出爐率,問新的操作能否提高出爐率
命令:
X<-c(78.1,72.4,76.2,74.3,77.4,78.4,76.0,75.5,76.7,77.3)
Y<-c(79.1,81.0,77.3,79.1,80.0,79.1,79.1,77.3,80.2,82.1)
t.test(X, Y, var.equal=TRUE, alternative = "less")
成對數(shù)據(jù)t檢驗(yàn)
例三
對每個(gè)高爐進(jìn)行配對t檢驗(yàn)
命令:
X<-c(78.1,72.4,76.2,74.3,77.4,78.4,76.0,75.5,76.7,77.3)
Y<-c(79.1,81.0,77.3,79.1,80.0,79.1,79.1,77.3,80.2,82.1)
t.test(X-Y, alternative = "less")
正態(tài)總體方差的假設(shè)檢驗(yàn)
例四
從小學(xué)5年級(jí)男生中抽取20名,測量其身高(厘米)如下:
問,在0.05顯著性水平下,
平均值是否等于149
sigma^2 是否等于 75
命令:
X<-scan()
136 144 143 157 137 159 135 158 147 165
158 142 159 150 156 152 140 149 148 155
var.test(X,Y)
例五
對煉鋼爐的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析
命令:
X<-c(78.1,72.4,76.2,74.3,77.4,78.4,76.0,75.5,76.7,77.3)
Y<-c(79.1,81.0,77.3,79.1,80.0,79.1,79.1,77.3,80.2,82.1)
var.test(X,Y)
二項(xiàng)分布的總體檢驗(yàn)
例六 有一批蔬菜種子的平均發(fā)芽率為P=0.85,現(xiàn)在隨機(jī)抽取500粒,用種衣劑進(jìn)行浸種處理,結(jié)果有445粒發(fā)芽,問種衣劑有無效果。
命令:
binom.test(445,500,p=0.85)
例七 按照以往經(jīng)驗(yàn),新生兒染色體異常率一般為1%,某醫(yī)院觀察了當(dāng)?shù)?00名新生兒,有一例染色體異常,問該地區(qū)新生兒染色體是否低于一般水平?
命令:
binom.test(1,400,p=0.01,alternative="less")
非參數(shù)檢驗(yàn)
#數(shù)據(jù)是否正態(tài)分布的Neyman-Pearson 擬合優(yōu)度檢驗(yàn)-chisq
例八
5種品牌啤酒愛好者的人數(shù)如下
A 210
B 312
C 170
D 85
E 223
問不同品牌啤酒愛好者人數(shù)之間有沒有差異?
命令:
X<-c(210, 312, 170, 85, 223)
chisq.test(X)
例九
檢驗(yàn)學(xué)生成績是否符合正態(tài)分布
命令:
X<-scan()
25 45 50 54 55 61 64 68 72 75 75
78 79 81 83 84 84 84 85 86 86 86
87 89 89 89 90 91 91 92 100
A<-table(cut(X, br=c(0,69,79,89,100)))
p<-pnorm(c(70,80,90,100), mean(X), sd(X))
p<-c(p[1], p[2]-p[1], p[3]-p[2], 1-p[3])
chisq.test(A,p=p)
# cut 將變量區(qū)域劃分為若干區(qū)間
# table 計(jì)算因子合并后的個(gè)數(shù)
# 均值之間有無顯著區(qū)別
大麥的雜交后代芒性狀的比例 無芒:長芒: 短芒=9:3:4,而實(shí)際觀測值為335:125:160 ,檢驗(yàn)觀測值是否符合理論假設(shè)?
命令:
chisq.test(c(335, 125, 160), p=c(9,3,4)/16)
例十
# 現(xiàn)有42個(gè)數(shù)據(jù),分別表示某一時(shí)間段內(nèi)電話總機(jī)借到呼叫的次數(shù),
# 接到呼叫的次數(shù) 0 1 2 3 4 5 6
# 出現(xiàn)的頻率 7 10 12 8 3 2 0
# 問:某個(gè)時(shí)間段內(nèi)接到的呼叫次數(shù)是否符合Possion分布?
命令:
x<-0:6
y<-c(7,10,12,8,3,2,0)
mean<-mean(rep(x,y))
q<-ppois(x,mean)
n<-length(y)
p[1]<-q[1]
p[n]<-1-q[n-1]
for(i in 2:(n-1))
p<-q-q
chisq.test(y, p=p)
Z<-c(7, 10, 12, 8)
n<-length(Z); p<-p[1:n-1]; p[n]<-1-q[n-1]
chisq.test(Z, p=p);http://www.3lll3.cn/
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