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一文講解機器學(xué)習(xí)算法中的共線性問題
2020-01-08
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一文講解<a href='/map/jiqixuexi/' style='color:#000;font-size:inherit;'>機器學(xué)習(xí)</a>算法中的共線性問題

作者 | 宋老師

來源 | JSong的數(shù)據(jù)科學(xué)小站

多重共線性是使用線性回歸算法時經(jīng)常要面對的一個問題。在其他算法中,例如決策樹和貝葉斯,前者的建模過程是逐步遞進,每次拆分只有一個變量參與,這種建模機制含有抗多重共線性干擾的功能;后者干脆假定變量之間是相互獨立的,因此從表面上看,也沒有多重共線性的問題。但是對于回歸算法,不論是一般回歸,邏輯回歸,或存活分析,都要同時考慮多個預(yù)測因子,因此多重共線性是不可避免需要面對的,在很多時候,多重共線性是一個普遍的現(xiàn)象。在構(gòu)造預(yù)測模型時如何處理多重共線性是一個比較微妙的議題。既不能不加控制,又不能一刀切,認為凡是多重共線性就應(yīng)該消除。

1、共線性的原理

假設(shè)有k個自變量的多元線性回歸模型:

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其中誤差項是一個期望值為0且服從正態(tài)分布的隨機變量:

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則利用最小二乘法可得參數(shù)的估計值為:

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該求解公式唯一的條件是矩陣X是列滿秩的,不然會有無窮多解:

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當各變量之間存在共線性問題,即各變量之間存在部分線性相關(guān)時,例如:

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易知此時X近乎是不滿秩的(實際情況很難完全共線性),X^TX近乎是奇異的,X的最小奇異值會非常小,那它的影響到底有多大呢?我們先從矩陣計算的角度來看。

1.1 擾動分析

對于一個方程或者系統(tǒng)而言,當輸入有一個非常微小的擾動時,我們希望方程或系統(tǒng)的輸出變化也非常微小,如果輸出的變化非常大,且不能被控制,那這個系統(tǒng)的預(yù)測就無效了,蝴蝶效應(yīng)講的就是這個。在矩陣計算中,這叫做擾動分析

擾動分析定理】設(shè)非奇異方陣A滿足方程

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它的精確解為x* ,當A存在一個小擾動時,假設(shè) $\hat{x}$ 是新方程的解:

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可以證明x* 的擾動滿足:

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可以看到矩陣的條件數(shù)越大,擾動就越大,即x的求解值會變得非常不準確?;氐缴厦嬷v的線性回歸問題,容易證明最小二乘法的解滿足下面的正定方程:

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此時

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當方程有共線性問題時,X的最小特征值非常小,相應(yīng)的,上述的條件數(shù)會非常大。也就是說機器學(xué)習(xí)中的共線性問題實際上就是矩陣計算中的條件數(shù)問題。

從實際應(yīng)用的角度,一般若K<100,則認為多重共線性的程度很小,若是100<=K<=1000,則認為存在一般程度上的多重共線性,若是K>1000,則就認為存在嚴重的多重共線性。

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1.2 方差分析

再從統(tǒng)計學(xué)的角度來看共線性??梢宰C明參數(shù)的協(xié)方差矩陣為

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又對任意的常數(shù)矩陣A和隨機變量x有

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代入上式即可得

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具體到每個參數(shù),有:

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其中是將第i個變量作為因變量,其他k-1個變量作為自變量進行線性回歸獲得的,且令

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方差膨脹因子(variance inflation factor,VIF)。當

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時,即當?shù)趇個變量和其他變量之間存在線性關(guān)系時,VIF趨于無窮大。所以 VIF 的大小反應(yīng)了變量的共線性程度。一般地,當VIF大于5或10時,認為模型存在嚴重的共線性問題。

同時考慮參數(shù)顯著性檢驗的 t 統(tǒng)計量

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當存在共線性時,參數(shù)的標準差偏大,相應(yīng)的 t 統(tǒng)計量 會偏小,這樣容易淘汰一些不應(yīng)淘汰的解釋變量,使統(tǒng)計檢驗的結(jié)果失去可靠性。

另外考慮線性回歸的殘差

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其中M是一個投影矩陣,且滿足

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易證明

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而矩陣M的范數(shù)與X的條件數(shù)毫無關(guān)系,于是可以得出共線性并不影響模型的訓(xùn)練精度。但是對于泛化精度,由于參數(shù)的估計已經(jīng)不準確啦,所以泛化誤差肯定要差些,具體差多少,我還很難用公式表示出來。

總結(jié)一下,共線性問題對線性回歸模型有如下影響:

  • 參數(shù)的方差增大;
  • 難以區(qū)分每個解釋變量的單獨影響;
  • 變量的顯著性檢驗失去意義;
  • 回歸模型缺乏穩(wěn)定性。樣本的微小擾動都可能帶來參數(shù)很大的變化;
  • 影響模型的泛化誤差。

2、共線性問題的解決方法

根據(jù)上一節(jié)的描述,共線性問題有如下幾種檢驗方法:

  • 相關(guān)性分析。檢驗變量之間的相關(guān)系數(shù);
  • 方差膨脹因子VIF。當VIF大于5或10時,代表模型存在嚴重的共線性問題;
  • 條件數(shù)檢驗。當條件數(shù)大于100、1000時,代表模型存在嚴重的共線性問題。

當變量數(shù)不多,樣本數(shù)不是很大時,上述的方法是沒問題的,檢驗?zāi)硞€變量有共線性問題時,可以結(jié)合實際業(yè)務(wù)考慮直接剔除該變量。但是有的時候變量數(shù)大到有上千個,VIF的計算需要建立上千個回歸模型(條件數(shù)僅能判定是否存在共線性,但不能找到對應(yīng)的變量),這將耗費很長時間。

事實上我們可以從模型角度來直接規(guī)避共線性問題。

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2.1 PCA降維

主成分分析法作為多元統(tǒng)計分析的一種常用方法在處理多變量問題時具有其一定的優(yōu)越性,其降維的優(yōu)勢是明顯的,主成分回歸方法對于一般的多重共線性問題還是適用的,尤其是對共線性較強的變量之間。當采取主成分提取了新的變量后,往往這些變量間的組內(nèi)差異小而組間差異大,起到了消除共線性的問題。

2.2 逐步回歸法

逐步回歸(Stepwise Regression)是一種常用的消除多重共線性、選取“最優(yōu)”回歸方程的方法。其做法是將逐個引入自變量,引入的條件是該自變量經(jīng)F檢驗是顯著的,每引入一個自變量后,對已選入的變量進行逐個檢驗,如果原來引入的變量由于后面變量的引入而變得不再顯著,那么就將其剔除。引入一個變量或從回歸方程中剔除一個變量,為逐步回歸的一步,每一步都要進行F 檢驗,以確保每次引入新變量之前回歸方程中只包含顯著的變量。這個過程反復(fù)進行,直到既沒有不顯著的自變量選入回歸方程,也沒有顯著自變量從回歸方程中剔除為止。

  • 第一:建立全部變量的回歸方程
  • 第二:分別建立單獨的回歸方程,依照t檢驗和擬合度依次加入各變量來構(gòu)建回歸方程
  • 第三:判斷新引入的變量,對于之前的系數(shù)影響是否顯著,是否符合實際以及對于擬合度的變量,來選擇是否將變量引入模型中。

2.3 嶺回歸、L2正則化(ridge regression)

嶺回歸是一種可用于共線性數(shù)據(jù)分析的有偏估計回歸方法,它是一種改良的最小二乘估計法,通過放棄最小二乘法的無偏性,以損失部分信息、降低精度為代價獲得回歸系數(shù)更為符合實際、更可靠的回歸方法,對條件數(shù)很大(病態(tài)數(shù)據(jù))的擬合要強于最小二乘法。

線性回歸問題中,最小二乘法實際上是最小化問題:

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而嶺回歸則是加入了L2懲罰項:

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這樣參數(shù)的方差不會過大,且隨著懲罰項系數(shù)C的增大,共線性的影響將越來也小。在這個過程中,可以記錄 (嶺跡)的變化情況,通過對嶺跡的波動來判斷我們是否要剔除該變量。

那為什么說嶺回歸能解決共線性問題呢?從矩陣計算的角度來看,L2正則化下方程的解為:

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在上一節(jié)我們講到共線性代表正定矩陣X^T^X的條件數(shù)很大:

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而當條件數(shù)很大時,矩陣的逆的數(shù)值計算也是非常不準確的,但是當我們給矩陣加上一個單位矩陣時,奇異性(不可逆)問題就完全沒有啦。

進一步考慮對懲罰項對奇異值的影響,假設(shè)X的奇異值(SVD)分解為:

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則容易證明

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其中D是對角矩陣,且滿足

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其反應(yīng)了懲罰項是如何影響到條件數(shù)的。

2.4 LASSO回歸

LASSO回歸和嶺回歸類似,只不過將懲罰項由L2范數(shù)改為了L1范數(shù)

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L1范數(shù)沒有L2范數(shù)那么圓潤,畢竟存在不可導(dǎo)點,而且在L1范數(shù)下LASSO回歸也給不出解析解啦,但是相對于嶺回歸,LASSO估計的參數(shù)能更容易收斂到0

2.5 ElasticNet回歸等

ElasticNet回歸同時兼顧了L1和L2懲罰項:

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當許多變量是相關(guān)的時候,Elastic-net是有用的。Lasso一般會隨機選擇其中一個,而Elastic-net則會選在兩個。

除此之外,還有L0范數(shù)(非零元的個數(shù))、L1/2范數(shù)等。

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3、Python實踐

首先捏造一份好的數(shù)據(jù),樣本量為100,特征數(shù)為8,且滿足方程:

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其中誤差項是期望為0,標準差為1.5的正態(tài)分布隨機變量。

import numpy as npfrom sklearn.linear_model import LinearRegressionfrom sklearn import cross_validation

coef0=np.array([5,6,7,8,9,10,11,12])
X1=np.random.rand(100,8)
y=np.dot(X1,coef0)+np.random.normal(0,1.5,size=100)
training=np.random.choice([True,False],p=[0.8,0.2],size=100)
lr1=LinearRegression()
lr1.fit(X1[training],y[training])# 系數(shù)的均方誤差MSEprint(((lr1.coef_-coef0)**2).sum()/8)# 測試集準確率(R2)print(lr1.score(X1[~training],y[~training]))# 平均測試集準確率print(cross_validation.cross_val_score(lr1,X1,y,cv=5).mean())

此時平均準確率為0.934955,擬合的系數(shù)MSE為0.203657

然后我們基于這份數(shù)據(jù)另外構(gòu)造出兩份數(shù)據(jù),第二份數(shù)據(jù)增加兩個隨機的特征用作對比,第一份數(shù)據(jù)則增加兩個共線性特征

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X2=np.column_stack([X1,np.dot(X1[:,[0,1]],np.array([1,1]))+np.random.normal(0,0.05,size=100)])
X2=np.column_stack([X2,np.dot(X2[:,[1,2,3]],np.array([1,1,1]))+np.random.normal(0,0.05,size=100)])
X3=np.column_stack([X1,np.random.rand(100,2)])

先來看下它們的條件數(shù)

>>>print(np.linalg.cond(X1))
>>>print(np.linalg.cond(X2))
>>>print(np.linalg.cond(X3))6.29077685383110.9306124087.25066276479

可以看到X2的條件數(shù)很搭,最小奇異值為0.213,此時還不至于完全共線性。

拿這兩份數(shù)據(jù)重新用線性回歸擬合模型。

lr2=LinearRegression()
lr2.fit(X2[training],y[training])# 系數(shù)的均方誤差MSEprint(((lr2.coef_[:8]-coef0)**2).sum()/8)# 測試集準確率(R2)print(lr2.score(X2[~training],y[~training]))# 平均測試集準確率print(cross_validation.cross_val_score(lr2,X2,y,cv=5).mean())

lr3=LinearRegression()
lr3.fit(X3[training],y[training])# 系數(shù)的均方誤差MSEprint(((lr3.coef_[:8]-coef0)**2).sum()/8)# 測試集準確率(R2)print(lr3.score(X3[~training],y[~training]))# 平均測試集準確率print(cross_validation.cross_val_score(lr3,X3,y,cv=5).mean())

對于第二份共線性構(gòu)造數(shù)據(jù)X2,有平均測試集準確率為0.932070,擬合的參數(shù)MSE為7.697837??梢钥吹組SE增加了很多,準確率也下降了0.2%,測試擬合的系數(shù)為:

>>>print(lr2.coef_)
[ 10.506618 11.467777 6.35562175 7.56698262 9.44509206
 9.81032939 11.66187822 12.29728702 -5.07439399 0.02649089]

在來看對比用的數(shù)據(jù)X3,其平均測試集準確率為0.934952,參數(shù)MSE為0.171651,與X1無異。

以上是直接的結(jié)果,我們再來看VIF

import matplotlib.pyplot as plt
vif2=np.zeros((10,1))for i in range(10):
 tmp=[k for k in range(10) if k!=i]
 clf.fit(X2[:,tmp],X2[:,i])
 vifi=1/(1-clf.score(X2[:,tmp],X2[:,i]))
 vif2[i]=vifi

vif3=np.zeros((10,1))for i in range(10):
 tmp=[k for k in range(10) if k!=i]
 clf.fit(X3[:,tmp],X3[:,i])
 vifi=1/(1-clf.score(X3[:,tmp],X3[:,i]))
 vif3[i]=vifi 
plt.figure()
ax = plt.gca()
ax.plot(vif2)
ax.plot(vif3)
plt.xlabel('feature')
plt.ylabel('VIF')
plt.title('VIF coefficients of the features')
plt.axis('tight')
plt.show()
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可以看到第0、1、2、3、8、9個特征的VIF都過高。且可以看出第1個特征相對第0、2、3個特征的VIF較高。

最后我們試著用模型的方法來檢測共線性問題

from sklearn.linear_model import Ridge
plt.figure()
n_alphas = 20alphas = np.logspace(-1,4,num=n_alphas)
coefs = []for a in alphas:
 ridge = Ridge(alpha=a, fit_intercept=False)
 ridge.fit(X2, y)
 coefs.append(ridge.coef_)
ax = plt.gca()
ax.plot(alphas, coefs)
ax.set_xscale('log')
handles, labels = ax.get_legend_handles_labels()
plt.legend(labels=[0,1,2,3,4,5,6,7,8,9])
plt.xlabel('alpha')
plt.ylabel('weights')
plt.title('Ridge coefficients as a function of the regularization')
plt.axis('tight')
plt.show()

其中當alpha取0.1時,嶺回歸估計的系數(shù)分別為

>>>print(coefs[0])
[ 2.70748655 0.95748918 3.53687372 5.2073456 8.70186695
 9.84484102 10.67351759 11.74614246 2.46502016 3.19919212]

可以看到第0、1、2、3、8、9個變量都出現(xiàn)了波動,代表它們之間存在一定的共線性。觀察嶺跡,我們可以考慮剔除其中波動比較大的第1、8、9個變量。

另外Lasso回歸類似,可以用sklearn中的linear_model.Lasso來學(xué)習(xí),這里就不展示了。最后對于邏輯回歸任務(wù),sklearn函數(shù)內(nèi)部提供了L1或L2正則化方案,通過它們也可以去檢測共線性問題。

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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調(diào)用 initGeetest 進行初始化 // 參數(shù)1:配置參數(shù) // 參數(shù)2:回調(diào),回調(diào)的第一個參數(shù)驗證碼對象,之后可以使用它調(diào)用相應(yīng)的接口 initGeetest({ // 以下 4 個配置參數(shù)為必須,不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺檢測極驗服務(wù)器是否宕機 new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機時表示是新驗證碼的宕機 product: "float", // 產(chǎn)品形式,包括:float,popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請參見:http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計時完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請輸入'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var errTxt = '請輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }