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R語言利用caret包比較模型性能差異
2018-05-18
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R語言利用caret包比較模型性能差異

我們可以通過重采樣的方法得對每一個匹配模型的統(tǒng)計信息，包括ROC曲線，靈敏度與特異度，然后基于這些統(tǒng)計信息來比較不同模型的性能差異。
操作
利用上節(jié)的信息，準備好glm分類模型，svm分類模型，rpart分類模型，并存放在glm.model,svm.model,rpart.model。
cv.values = resamples(list(glm = glm.model,svm =svm.model,rpart = rpart.model))
> summary(cv.values)

Call:
summary.resamples(object = cv.values)

Models: glm, svm, rpart
Number of resamples: 30

ROC
           Min.   1st Qu.    Median      Mean   3rd Qu.      Max. NA's
glm   0.7597790 0.7927740 0.8040455 0.8106454 0.8347961 0.8760824    0
svm   0.8191998 0.8786439 0.8945208 0.8947360 0.9196775 0.9562556    0
rpart 0.6064540 0.7150320 0.7608241 0.7556544 0.8086731 0.8554750    0

Sens
            Min.   1st Qu.    Median      Mean   3rd Qu.      Max. NA's
glm   0.08823529 0.1764706 0.2058824 0.2124930 0.2516807 0.3235294    0
svm   0.44117647 0.5294118 0.5882353 0.5956863 0.6470588 0.7941176    0
rpart 0.20000000 0.4117647 0.4705882 0.4787955 0.5514706 0.7352941    0

Spec
           Min.   1st Qu.    Median      Mean   3rd Qu.      Max. NA's
glm   0.9393939 0.9645119 0.9721581 0.9702721 0.9796954 0.9898477    0
svm   0.9494949 0.9695431 0.9771574 0.9755004 0.9847716 0.9898990    0
rpart 0.9492386 0.9746193 0.9796954 0.9780359 0.9848485 1.0000000    0

使用dotplot函數(shù)繪制重采樣在ROC曲線度量中的結果：

dotplot(cv.values,metric = "ROC")

使用箱線圖繪制重采樣結果：

bwplot(cv.values,layout=c(3,1))


重采樣結果箱線圖

說明

我們使用resample函數(shù)生成各個模型的統(tǒng)計信息，再調用summary函數(shù)輸出三個模型在ROC、靈敏度及特異性上的統(tǒng)計信息。使用dotplot方法處理重采樣結果來觀測不同模型ROC差異，最后，采用箱線圖在同一張圖上對ROC、靈敏度及特異方面的差別進行比較。



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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調用 initGeetest 進行初始化 // 參數(shù)1：配置參數(shù) // 參數(shù)2：回調，回調的第一個參數(shù)驗證碼對象，之后可以使用它調用相應的接口 initGeetest({ // 以下 4 個配置參數(shù)為必須，不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺檢測極驗服務器是否宕機 new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機時表示是新驗證碼的宕機 product: "float", // 產品形式，包括：float，popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請參見：http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計時完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請輸入'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var errTxt = '請輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }