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巧用R的write函數(shù)實現(xiàn)帶，數(shù)據(jù)txt文件輸出
2017-07-09
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巧用R的write函數(shù)實現(xiàn)帶，數(shù)據(jù)txt文件輸出

今天天氣不錯，打開電腦，有一同學問我，他說在做基因分析時，常會出現(xiàn)輸出的都是一列形式保存的。然而，在實際應用當中，常會出現(xiàn)以一行的帶“，”形式保存的數(shù)據(jù)。

筆者分別用了二種方式都實現(xiàn)了數(shù)據(jù)格式的轉換。現(xiàn)介紹一簡單的方法，巧利用write函數(shù)進行轉換。

筆者不以基因為例創(chuàng)建 。而以最簡單的1到100的數(shù)字進行演練。

a<-c(1:100)  #創(chuàng)建一個1到100的數(shù)據(jù)。

#然后我們 保存為txt文件。
> write.table(a,"111.txt",row.names =F, col.names =F, quote =F)    #語句好多是生信常用的

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還可以使用 paste(a,collosape = ",) 函數(shù)。大家可以慢慢琢磨。

在尋找差異基因的時候 。我們可能在保存數(shù)據(jù)時。常要找合并的基因，可能會對大家有幫助，如何從TCGA數(shù)據(jù)里挖掘出相關的基因，這些都是基本功。


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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調用 initGeetest 進行初始化 // 參數(shù)1：配置參數(shù) // 參數(shù)2：回調，回調的第一個參數(shù)驗證碼對象，之后可以使用它調用相應的接口 initGeetest({ // 以下 4 個配置參數(shù)為必須，不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺檢測極驗服務器是否宕機 new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機時表示是新驗證碼的宕機 product: "float", // 產(chǎn)品形式，包括：float，popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請參見：http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計時完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請輸入'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var errTxt = '請輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }