
R語言分類算法之線性判別分析(Linear Discriminant Analysis)
1.線性判別原理解析
基本思想是”投影”,即高緯度空間的點(diǎn)向低緯度空間投影,從而簡(jiǎn)化問題的處理.在原坐標(biāo)系下,空間中的點(diǎn)可能很難被分開,如圖8-1,當(dāng)類別Ⅰ和類別Ⅱ中的樣本點(diǎn)都投影至圖中的”原坐標(biāo)軸”后,出現(xiàn)了部分樣本點(diǎn)的”影子”重合的情況,這樣就無法將分屬于這兩個(gè)類別的樣本點(diǎn)區(qū)分開來;而如果使用如圖8-2中的”投影軸”進(jìn)行投影,所得到的”影子”就可以被”類別劃分線”明顯地區(qū)分開來.
費(fèi)希爾判別最重要的就是選擇出適當(dāng)?shù)耐队拜S,對(duì)該投影軸方向上的要求是:保證投影后,使每一類之內(nèi)的投影值所形成的類內(nèi)離盡可能小,而不同類之間的投影值所形成的類間距離差盡可能大.
對(duì)線性判別來說,線將樣本點(diǎn)投影到一維空間,即直線上,若效果不明顯,則可以考慮增加一個(gè)緯度,即投影到二維空間,依此類推.
而二次判別(Quadratic Discriminant Analysis,QDA)與線性判別(Linear Discriminant
Analysis,LDA)的區(qū)別就在于投影面的形狀不同,二次判別使用若干次曲面,而非直線或平面來將樣本劃分至相應(yīng)的類別中.二次判別函數(shù)是一種常用的非線性判別函數(shù).
2.在R語言中的應(yīng)用
MASS包是Modern Applied Statistics with S
的縮寫,即S語言在現(xiàn)代統(tǒng)計(jì)中的應(yīng)用。線性判別分析(LDA)主要用到了lda(formula,data,…,subset,na.action)函數(shù),二次判別分析(QDA)則用到了qda(formula,data,…,subset,na.action)函數(shù)。
3.以iris數(shù)據(jù)集為例進(jìn)行線性判別分析
1)應(yīng)用模型并查看模型的相應(yīng)參數(shù)
library(MASS) fit_lda1=lda(Species~.,data_train) fit_lda1
2)查看模型的輸出結(jié)果
fit_lda1[1:length(fit_lda1)]
3)做出模型圖
plot(fit_lda1)
plot(fit_lda1,dimen=1)
4)對(duì)data_test進(jìn)行預(yù)測(cè),并觀察預(yù)測(cè)結(jié)果
pre_ldal=predict(fit_lda1,data_test)
pre_ldal[1:length(pre_ldal)]
5)評(píng)測(cè)預(yù)測(cè)結(jié)果
table(data_test$Species,pre_ldal$class)error_lda1=sum(as.numeric(as.numeric(pre_ldal$class)!=as.numeric(data_test$Species)))/nrow(data_test)
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