
什么是關(guān)系型數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)
數(shù)據(jù)庫(Database)是一種數(shù)據(jù)的組織和存儲方式,通常用于處理結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù)。
而關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(Relational Database)指的是創(chuàng)建在關(guān)系模型的基礎(chǔ)上的數(shù)據(jù)庫。它借助于集合代數(shù)等數(shù)學(xué)概念和方法來處理數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)。
數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)(DBMS,Database Management System),是一種專門用于存儲、修改并從數(shù)據(jù)庫提取信息的系統(tǒng)軟件。
主流的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)主要有:MySQL,ORACLE, MS ACCESS,DB2等。
其中,MySQL屬于開源軟件,而其他的主流數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)基本都是商業(yè)軟件。由于很多互聯(lián)網(wǎng)公司數(shù)據(jù)庫都是采用MySQL進(jìn)行數(shù)據(jù)庫的管理,所以今天我們主要介紹MySQL的安裝、配置及其與R的交互。
SQL(Structured Query Language)是一種專門用來與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行溝通的語言。
使用SQL可以對數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進(jìn)行增、刪、查、改、權(quán)限管理等操作。
常用關(guān)鍵詞:SELECT,UPDATE,DELETE,INSERT.
管理關(guān)鍵詞:CREATE,ALTER,DROP
常用子句、關(guān)鍵詞:FROM,WHERE,GROUP BY,ORDER BY
為什么要學(xué)習(xí)SQL
很多同學(xué)可能會很疑惑:對于數(shù)據(jù)的增刪查改等需求,我們的R不是已經(jīng)有非常方便的操作了嗎?為什么還要多學(xué)一門語言呢?
R擅長的領(lǐng)域是數(shù)據(jù)分析,然而,對于數(shù)據(jù)存儲,卻存在很大的問題。一個非常明顯的缺陷是:所有數(shù)據(jù)均要讀入內(nèi)存。這就造成了R能處理的數(shù)據(jù)量存在一個瓶頸。當(dāng)我們要處理的數(shù)據(jù)觀測數(shù)達(dá)到上億級別的時候,R就顯得力所不逮了。
數(shù)據(jù)庫能解決的當(dāng)然不止這一個問題。
當(dāng)我們遇到如下情景時,數(shù)據(jù)庫就顯得非常重要了:
當(dāng)你的數(shù)據(jù)需要通過網(wǎng)站在線展示;
當(dāng)你在一個團隊中工作,你和你的協(xié)作成員要同時操作同一個數(shù)據(jù)集;
當(dāng)你需要為不同的數(shù)據(jù)用戶賦予不同的使用權(quán)限;
當(dāng)你要處理的數(shù)據(jù)量超過了你的電腦內(nèi)存;
當(dāng)你面對的數(shù)據(jù)集非常復(fù)雜,不能統(tǒng)一組織到一個數(shù)據(jù)集中時;
當(dāng)你的數(shù)據(jù)量非常龐大,但你又經(jīng)常要頻繁地獲取它的一些子集時;
當(dāng)你的幾個數(shù)據(jù)集關(guān)聯(lián)性很大,更新一個數(shù)據(jù)集需要同時更新另外一些數(shù)據(jù)集時;
當(dāng)你對數(shù)據(jù)的格式要求很嚴(yán)格時。
而如果我們經(jīng)常與數(shù)據(jù)打交道,以上的問題是必不可免的。
可見,要想成為一名優(yōu)秀的數(shù)據(jù)科學(xué)家,學(xué)習(xí)SQL還是非常有必要的。
當(dāng)然,SQL雖然是一門語言,但是它有一些非常吸引人的優(yōu)點:
幾乎所有重要的DBMS都支持SQL;
SQL語法簡明,簡單易學(xué);
SQL非常靈活,功能強大。
所以,雖然又得多學(xué)一門語言,但是也不必苦惱。想想能夠幾天掌握一門新的語言,也是挺讓人激動的呢:)
MySQL的安裝及環(huán)境配置
MySQL是一款開軟的數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng),因此我們可以通過在官網(wǎng)進(jìn)行軟件的自由下載安裝。
對于入門的同學(xué)來說,MySQL Community Server和MySQL Workbench CE結(jié)合起來使用是一個不錯的開始。MySQL Workbench CE是MySQL的一個開發(fā)環(huán)境,具有非常友好的交互界面。它跟MySQL的關(guān)系如同Rstudio和R的關(guān)系。
SQL基本操作——案例學(xué)習(xí)
安裝完畢,我們就可以啟動MySQL Workbench進(jìn)行數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建等操作了。先使用root用戶身份(在安裝的過程中創(chuàng)建)進(jìn)入管理界面。
建立一個數(shù)據(jù)庫
新建一個SQL腳本,即可以開始MySQL的編程了。選中某一個代碼塊,使用CTRL+ENTER快捷鍵即可運行代碼。
create database db1;
show databases;
-- 創(chuàng)建一個普通用戶
CREATE USER yy@localhost IDENTIFIED BY '123';
建立一個表格
use db1;
create table birthdays(
nameid INTEGER NOT NULL AUTO_INCREMENT,
firstname varchar(100) not null,
lastname varchar(100) not null,
birthday date,
primary key (nameid)
);
添加觀測數(shù)據(jù)
insert into birthdays(firstname,lastname,birthday)
values ('peter','Pascal','1991-02-01'),
('paul','panini','1992-03-02');
使用查詢語句
select * from birthdays;
select birthday from birthdays;
追加數(shù)據(jù)
insert into birthdays(nameid,firstname,lastname,birthday)
values (10,"Donald","Docker","1934-06-09");
SQL與R的交互
R與SQL交互的拓展包非常豐富,不過大致可以分為三大類:
依賴于DBIpackage,如RMySQL,ROracle,RPosttgreSQL,RSQLite。這種方式通過與DBMS建立原始的連接實現(xiàn)數(shù)據(jù)庫操作。
依賴于RODBCpackage。這個包通過打開數(shù)據(jù)庫連接驅(qū)動的方式建立非直接的連接。如通過依賴于jre讀入XLS/XLSX表格的數(shù)據(jù)。
通過dplyr package.
今天主要介紹第1種及第三種方式。
R連接MySQL
操作數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)
下面,我們通過R來操作前面在MySQL中建立的數(shù)據(jù)庫db1。
library(RMySQL)
# 建立一個連接
mydb <- dbConnect(MySQL(),user="root",
password = "mycode",
dbname = "db1")
#查看表格
dbListTables(mydb)
## [1] "birthdays" "mtcars" "test"
#查看某一列
dbListFields(mydb,"birthdays")
## [1] "nameid" "firstname" "lastname" "birthday"
#
#dbClearResult(dbListResults(mydb)[[1]])
# 建立一個查詢
rs <- dbSendQuery(mydb,"select * from birthdays")
data<-fetch(rs,n = -1)
head(data)
## nameid firstname lastname birthday
## 1 1 peter Pascal 1991-02-01
## 2 2 paul panini 1992-03-02
## 3 10 Donald Docker 1934-06-09
# 另一種方法:建立一個查詢
dbGetQuery(mydb,"select * from birthdays")
## nameid firstname lastname birthday
## 1 1 peter Pascal 1991-02-01
## 2 2 paul panini 1992-03-02
## 3 10 Donald Docker 1934-06-09
將R中的data.frame存儲到數(shù)據(jù)庫
#將一個data frame對象存儲為一個表格
dbWriteTable(mydb,name = "mtcars",value = mtcars,overwrite=TRUE)
## [1] TRUE
#查看結(jié)果
dbListTables(mydb)
## [1] "birthdays" "mtcars" "test"
使用dplyr進(jìn)行數(shù)據(jù)庫操作
dplyr是Hadley大神開發(fā)的一個專注于data frame類型的數(shù)據(jù)操作的一個包。它擁有非常簡潔、便于記憶、異常豐富的一系列操作函數(shù)。更吸引人的是:它支持對sqlite,mysql,postgresql等開源數(shù)據(jù)庫的操作。也就是說:你無需掌握SQL語言也能輕松進(jìn)行數(shù)據(jù)庫操作。
當(dāng)然,dplyr并不能替代全部的SQL語言。它主要用于產(chǎn)生分析中最頻繁使用的SELECT語句。
下面我們看看這是如何做到的。
library(dplyr)
conDplyr<-src_mysql(dbname = "db1",user = "root",password = "mycode",host = "localhost")
mydata<-conDplyr %>%
tbl("mtcars") %>%
select(mpg,cyl,gear) %>%
filter(gear == 4) %>%
collect()
head(mydata)
## Source: local data frame [6 x 3]
##
## mpg cyl gear
## (dbl) (dbl) (dbl)
## 1 21.0 6 4
## 2 21.0 6 4
## 3 22.8 4 4
## 4 24.4 4 4
## 5 22.8 4 4
## 6 19.2 6 4
dplyr中的惰性求值
dplyr只有在必要的情況下才會執(zhí)行操作
它在必要的情況下才會從數(shù)據(jù)庫中載入數(shù)據(jù)
每一個操作函數(shù)在執(zhí)行的時候,并未開始真正從數(shù)據(jù)庫中請求,而是在必要的情況下,一起執(zhí)行.
如以下的一系列操作并未開始執(zhí)行數(shù)據(jù)提取:
library(dplyr)
myDF <- tbl(conDplyr,"mtcars")
myDF1<-filter(myDF,gear == 4)
myDF2<-select(myDF1,mpg,cyl,gear)
直到執(zhí)行以下語句,才真正開始從數(shù)據(jù)庫中提取數(shù)據(jù)。
head(myDF2)
## mpg cyl gear
## 1 21.0 6 4
## 2 21.0 6 4
## 3 22.8 4 4
## 4 24.4 4 4
## 5 22.8 4 4
## 6 19.2 6
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