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R語言各種假設(shè)檢驗(yàn)實(shí)例整理
2017-04-21
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一、正態(tài)分布參數(shù)檢驗(yàn)

例1. 某種原件的壽命X(以小時(shí)計(jì))服從正態(tài)分布N(μ, σ)其中μ, σ2均未知?,F(xiàn)測(cè)得16只元件的壽命如下:

159 280 101 212 224 379 179 264
                  222 362 168 250 149 260 485 170

問是否有理由認(rèn)為元件的平均壽命大于255小時(shí)?

解:按題意,需檢驗(yàn)

H0: μ ≤ 225     H1: μ >  225

此問題屬于單邊檢驗(yàn)問題

可以使用R語言t.test

t.test(x,y=NULL,

alternative=c("two.sided","less","greater"),

mu=0,paired=FALSE,var.equal=FALSE,

conf.level=0.95)

其中x,y是又?jǐn)?shù)據(jù)構(gòu)成e向量,(如果只提供x,則作單個(gè)正態(tài)總體的均值檢驗(yàn),如果提供x,y則作兩個(gè)總體的均值檢驗(yàn)),alternative表示被則假設(shè),two.sided(缺省),雙邊檢驗(yàn)(H1:μ≠H0),less表示單邊檢驗(yàn)(H1:μ<μ0),greater表示單邊檢驗(yàn)(H1:μ>μ0),mu表示原假設(shè)μ0,conf.level置信水平,即1-α,通常是0.95,var.equal是邏輯變量,var.equal=TRUE表示兩樣品方差相同,var.equal=FALSE(缺?。┍硎緝蓸颖痉讲畈煌?

R代碼:

X<-c(159, 280, 101, 212, 224, 379, 179, 264,
              222, 362, 168, 250, 149, 260, 485, 170)
       t.test(X,alternative = "greater",mu=225)

結(jié)果:

可見P值為0.257 > 0.05 ,不能拒絕原假設(shè),接受H0,即平均壽命不大于225小時(shí)。


例2.在平爐上進(jìn)行的一項(xiàng)試驗(yàn)以確定改變操作方法的建議是否會(huì)增加剛的得率,試驗(yàn)時(shí)在同一個(gè)平爐上進(jìn)行的,每煉一爐剛時(shí)除操作方法外,其它條件都盡可能做到相同,先用標(biāo)準(zhǔn)方法煉一爐,然后用新方法煉一爐,以后交替進(jìn)行,各煉了10爐,其得率分別為

標(biāo)準(zhǔn)方法    78.1 72.4 76.2 74.3 77.4 78.4 76.0 75.5 76.7 77.3
                           新方法        79.1 81.0 77.3 79.1 80.0 79.1 79.1 77.3 80.2 82.1

設(shè)這兩個(gè)樣本相互獨(dú)立,且分別來自正態(tài)總體N(μ1, σ2)和N(μ2, σ2),其中μ1,μ2和σ2未知。問新的操作能否提高得率?(取α=0.05)

解1:根據(jù)題意,需要假設(shè)

H0: μ1 ≥  μ2     H1: μ1 <  μ2  

這里假定σ12=σ22=σ2,因此選擇t.test,var.equal=TRUE

R代碼:

X<-c(78.1,72.4,76.2,74.3,77.4,78.4,76.0,75.5,76.7,77.3)
    Y<-c(79.1,81.0,77.3,79.1,80.0,79.1,79.1,77.3,80.2,82.1)
    t.test(X,Y,var.equal = TRUE,alternative = "less")

結(jié)果:

可見P值<0.05,接受備擇假設(shè),即新的操作能夠提高得率。


二、二項(xiàng)分布參數(shù)檢驗(yàn)

例3.有一批蔬菜種子的平均發(fā)芽率p0=0.85,現(xiàn)隨即抽取500粒,用種衣劑進(jìn)行浸種處理,結(jié)果有445粒發(fā)芽。試檢驗(yàn)種衣劑對(duì)種子發(fā)芽率有無效果。

解:根據(jù)題意,所檢驗(yàn)的問題為

H0:p=p0=0.85, H1:p≠p0

可以用R語言的binom.test

binom.test(x, n, p = 0.5,
                    alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
                     conf.level = 0.95)

其中x是成功的次數(shù);或是一個(gè)由成功數(shù)和失敗數(shù)組成的二維向量。n是試驗(yàn)總數(shù),當(dāng)x是二維向量時(shí),此值無效。P是原假設(shè)的概率。

R語言代碼:

binom.test(445,500,p=0.85)

結(jié)果:

可知P值0.01207<0.05,拒絕原假設(shè),說明種衣劑對(duì)種子的發(fā)芽率有顯著效果。

三、其它重要的非參數(shù)檢驗(yàn)法

3.1.理論分布完全已知的情況下

3.1.1.皮爾森擬合優(yōu)度檢驗(yàn)

例5.某消費(fèi)者協(xié)會(huì)為了確定市場(chǎng)上消費(fèi)者對(duì)5種品牌啤酒的喜好情況,隨即抽取了1000名啤酒愛好者作為樣品進(jìn)行試驗(yàn):每個(gè)人得到5種品牌的啤酒各一瓶,但未標(biāo)明牌子。這5種啤酒分別按著A、B、C、D、E字母的5張紙片隨即的順序送給每一個(gè)人。下表是根據(jù)樣本資料整理的各種品牌啤酒愛好者的頻數(shù)分布。試根據(jù)這些數(shù)據(jù)判斷消費(fèi)者對(duì)這5種品牌啤酒的愛好有無明顯差異?

最喜歡的牌子    A          B          C          D          E

人數(shù)X               210      312       170      85        223

解:如果消費(fèi)者對(duì)5種品牌的啤酒無顯著差異,那么,就可以認(rèn)為喜好這5種拍品啤酒的人呈均勻分布,即5種品牌啤酒愛好者人數(shù)各占20%。據(jù)此假設(shè)

H0:喜好5種啤酒的人數(shù)分布均勻

可以使用Pearson χ2擬合優(yōu)度檢驗(yàn),R語言中調(diào)用chisq.test(X)

chisq.test(x, y = NULL, correct = TRUE,
                   p = rep(1/length(x), length(x)), rescale.p = FALSE,
                   simulate.p.value = FALSE, B = 2000)

其中x是由觀測(cè)數(shù)據(jù)構(gòu)成的向量或者矩陣,y是數(shù)據(jù)向量(當(dāng)x為矩陣時(shí),y無效)。correct是邏輯變量,標(biāo)明是否用于連續(xù)修正,TRUE(缺省值)表示修正,F(xiàn)ALSE表示不修正。p是原假設(shè)落在小區(qū)間的理論概率,缺省值表示均勻分布,rescale.p是邏輯變量,選擇FALSE(缺省值)時(shí),要求輸入的p滿足和等于1;選擇TRUE時(shí),并不要求這一點(diǎn),程序?qū)⒅匦掠?jì)算p值。simulate.p.value邏輯變量(缺省值為FALSE),當(dāng)為TRUE,將用仿真的方法計(jì)算p值,此時(shí),B表示仿真的此值。

R語言代碼:

X<-c(210, 312, 170, 85, 223)

chisq.test(X)

結(jié)果:

3.1.2.正態(tài)W檢驗(yàn)

例7.已知15名學(xué)生體重如下,問是否服從正態(tài)分布

解:

R語言代碼:

w <- c(75.0, 64.0, 47.4, 66.9, 62.2, 62.2, 58.7, 63.5,
       66.6, 64.0, 57.0, 69.0, 56.9, 50.0, 72.0)
    shapiro.test(w)

P值>0.05,接受原假設(shè),認(rèn)為來自正態(tài)分布總體。

3.2.理論分布依賴于若干個(gè)未知參數(shù)的情況

3.2.1Kolmogorov-Smirnov 檢驗(yàn)

例8.對(duì)一臺(tái)設(shè)備進(jìn)行壽命檢驗(yàn),記錄10次無故障工作時(shí)間,并按從小到大的次序排列如下:(單位)

420  500 920  1380  1510  1650  1760 2100 2300 2350

試用Kolmogorov-Smirnov K 檢驗(yàn)方法檢驗(yàn)此設(shè)備無故障工作時(shí)間分布是否服從λ = 1/1500的指數(shù)分布?

解: R語言進(jìn)行Kolmogorov-Smirnov K 檢驗(yàn)使用ks.test( )

ks.test(x, y, ...,
    alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
    exact = NULL)    # x是待檢測(cè)的樣品構(gòu)成的向量,y是原假設(shè)的數(shù)據(jù)向量或是原假設(shè)的字符串。

R語言代碼:

X<-c(420, 500, 920, 1380, 1510, 1650, 1760, 2100, 2300, 2350)
        ks.test(X, "pexp", 1/1500)

P值大于0.05,無法拒絕原假設(shè),因此認(rèn)為此設(shè)備無故障工作時(shí)間的分布服從λ = 1/1500的指數(shù)分布。

例9.假定從分布函數(shù)未知的F(x)和G(x)的總體中分別抽出25個(gè)和20個(gè)觀察值的隨即樣品,其數(shù)據(jù)由下表所示?,F(xiàn)檢驗(yàn)F(x)和G(x)是否相同。

R語言代碼:

X<-scan( )
        0.61 0.29 0.06 0.59 -1.73 -0.74 0.51 -0.56
        1.64 0.05 -0.06 0.64 -0.82 0.37 1.77
        2.36 1.31 1.05 -0.32 -0.40 1.06 -2.47
        0.39 1.09 -1.28
        Y<-scan( )
        2.20 1.66 1.38 0.20 0.36 0.00
        0.96 1.56 0.44  1.50 -0.30 0.66       

2.31 3.29 -0.27 -0.37 0.38 0.70
        0.52 -0.71
        ks.test(X,Y)

P值>0.05,無法拒絕原假設(shè),說明F(x)和G(x)分布函數(shù)相同。

3.2.2.列聯(lián)表數(shù)據(jù)的檢驗(yàn)

例10.為了研究吸煙是否與患肺癌相關(guān),對(duì)63位肺癌患者及43名非肺癌患者(對(duì)照組)調(diào)查了其中的吸煙人數(shù),得到2x2列聯(lián)表,如下表所示

解:

進(jìn)行Pearson卡方檢驗(yàn)

R語言代碼:

x<-c(60, 3, 32, 11)
        dim(x)<- c(2,2)
        chisq.test(x,correct = F)

P值<0.05,拒絕原假設(shè),認(rèn)為吸煙與患肺癌相關(guān)。


3.2.3.符號(hào)檢驗(yàn)

例13.聯(lián)合國(guó)人員在世界上66個(gè)大城市的生活花費(fèi)指數(shù)(以紐約市1996年12月為100)按自小至大的次序排列如下(這里北京的指數(shù)為99):

66 75 78 80 81 81 82 83 83 83 83
       84 85 85 86 86 86 86 87 87 88 88
       88 88 88 89 89 89 89 90 90 91 91
       91 91 92 93 93 96 96 96 97 99 100
       101 102 103 103 104 104 104 105 106 109 109
       110 110 110 111 113 115 116 117 118 155 192 

假設(shè)這個(gè)樣品是從世界許多大城市中隨即抽樣得到的。試用符號(hào)檢驗(yàn)分析,北京是在中位數(shù)之上,還是在中位數(shù)之下。

解:樣本的中位數(shù)(M)作為城市生活水平的中間值,因此需要檢驗(yàn):

H 0 : M ≥ 99,  H 1 : M < 99.

輸入數(shù)據(jù),作二項(xiàng)檢驗(yàn)。

R語言代碼:

X <- c(66,75, 78 ,80 ,81 ,81 ,82, 83, 83, 83, 83,
           84 , 85, 85, 86, 86, 86, 86, 87 ,87, 88, 88,
           88, 88, 88, 89 ,89, 89, 89, 90 ,90 ,91 ,91,
           91 ,91, 92, 93, 93, 96, 96, 96, 97, 99, 100,
          101, 102, 103, 103 ,104, 104, 104 ,105, 106, 109, 109,
           110 ,110, 110, 111, 113, 115, 116, 117 ,118, 155 ,192)
     binom.test(sum(X>99), length(X), al="l")


在程序中,sum(x>99)表示樣本中大于99的個(gè)數(shù)。al是alternative的縮寫,"l"是"less"的縮寫。計(jì)算出的P值小于0.05,拒絕原假設(shè),也就是說,北京的生活水平高于世界的中位水平。

3.3.4.符號(hào)秩檢驗(yàn)

例16.假定某電池廠宣稱該廠生產(chǎn)的某種型號(hào)電池壽命的中位數(shù)為140安培小時(shí)。為了檢驗(yàn)改廠生產(chǎn)的電池是否符合其規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn),現(xiàn)從新近生產(chǎn)的一批電池中抽取了隨即樣本,并對(duì)這20個(gè)電池的壽命進(jìn)行了測(cè)試,其結(jié)果如下(單位:安培小時(shí)):

137.0 140.0 138.3 139.0 144.3 139.1 141.7 137.3 133.5 138.2

141.1 139.2 136.5 136.5 135.6 138.0 140.9 140.6 136.3 134.1

試用Wilcoxon符號(hào)秩檢驗(yàn)分析該廠生產(chǎn)的電池是否符合其標(biāo)準(zhǔn)。

解:根據(jù)題意假設(shè):

H0:電池中位數(shù)M≥ 140安培小時(shí);

H1:電池中位數(shù)<140安培小時(shí)。

R語言中進(jìn)行符號(hào)秩檢驗(yàn)可以使用wilcox.test( )

wilcox.test(x, y = NULL,
              alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
              mu = 0, paired = FALSE, exact = NULL, correct = TRUE,
              conf.int = FALSE, conf.level = 0.95, ...)

其中x,y是觀察數(shù)據(jù)構(gòu)成的數(shù)據(jù)向量。alternative是備擇假設(shè),有單側(cè)檢驗(yàn)和雙側(cè)檢驗(yàn),mu待檢參數(shù),如中位數(shù)M0.paired是邏輯變量,說明變量x,y是否為成對(duì)數(shù)據(jù)。exact是邏輯變量,說明是否精確計(jì)算P值,當(dāng)樣本量較小時(shí),此參數(shù)起作用,當(dāng)樣本兩較大時(shí),軟件采用正態(tài)分布近似計(jì)算P值。correct是邏輯變量,說明是否對(duì)P值的計(jì)算采用連續(xù)性修正,相同秩次較多時(shí),統(tǒng)計(jì)量要校正。conf.int是邏輯變量,說明是否給出相應(yīng)的置信區(qū)間。

R語言代碼:

X<-scan()
        137.0 140.0 138.3 139.0 144.3 139.1 141.7 137.3 133.5 138.2 141.1  139.2 136.5 136.5 135.6 138.0 140.9 140.6 136.3 134.1

         wilcox.test(X, mu=140, alternative="less",
               exact=FALSE,correct=FALSE, conf.int=TRUE)

這里V=34是wicoxon的統(tǒng)計(jì)量,P值<0.05,即拒絕原假設(shè),接受備擇假設(shè),中位值小于小于140安培小時(shí)。

例19.某醫(yī)院用某種藥物治療兩型慢性支氣管炎患者共216例,療效由下表所示,試分析該藥物對(duì)兩型慢性支氣管炎的治療是否相同。

解:我們想象各病人的療效用4個(gè)不同的值表示(1表示最好,4表示最差),這樣就可以位這216名排序,因此,可用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)來分析問題。

R語言代碼:

x<-rep(1:4, c(62, 41, 14,11)); y<-rep(1:4, c(20, 37, 16, 15))
    wilcox.test(x, y, exact=FALSE)

P值<0.05,拒絕原假設(shè),即認(rèn)為該藥物對(duì)兩型慢性支氣管炎的治療是不相同的。因?yàn)閿?shù)據(jù)有結(jié)點(diǎn)存在,故無法精確計(jì)算P值,其參數(shù)為exact=FALSE。 

3.3.5.二元數(shù)據(jù)相關(guān)檢驗(yàn)

例20.某種礦石中兩種有用成分A,B,取10個(gè)樣品,每個(gè)樣品中成分A的含量百分?jǐn)?shù)x(%),及B的含量百分?jǐn)?shù)y(%)的數(shù)據(jù)下表所示,對(duì)兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn)。

解:進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn),在R語言中可以使用cor.test( )

cor.test(x, y,
         alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
         method = c("pearson", "kendall", "spearman"),
         exact = NULL, conf.level = 0.95, ...)

#其中x,y是數(shù)據(jù)長(zhǎng)度相同的向量,alternative是備擇假設(shè),缺省值為"two.sided",method是檢驗(yàn)方法,缺省值是Pearson檢驗(yàn),conf.level是置信區(qū)間水平,缺省值為0.95

cor.test( )還有另一種使用格式

cor.test(formula, data, subset, na.action, ...) #其中formula是公式,形如'~u+v' , 'u', 'v' 必須是具有相同長(zhǎng)度的數(shù)值向量,data是數(shù)據(jù)框,subset是可選擇向量,表示觀察值的子集。   

假設(shè)此例中兩組數(shù)據(jù)均來自正態(tài)分布,使用pearson相關(guān)性檢驗(yàn),

R語言代碼:

ore<-data.frame(
         x=c(67, 54, 72, 64, 39, 22, 58, 43, 46, 34),
         y=c(24, 15, 23, 19, 16, 11, 20, 16, 17, 13)
    )
    cor.test(ore$x,ore$y)

可見P值<0.05,拒絕原假設(shè),認(rèn)為X與Y相關(guān)。

例21.一項(xiàng)有六個(gè)人參加表演的競(jìng)賽,有兩人進(jìn)行評(píng)定,評(píng)定結(jié)果用下表所示,試用Spearman秩相關(guān)檢驗(yàn)方法檢驗(yàn)這兩個(gè)評(píng)定員對(duì)等級(jí)評(píng)定有無相關(guān)關(guān)系。數(shù)據(jù)分析師培訓(xùn)

解:

R語言代碼:

x<-c(1,2,3,4,5,6); y<-c(6,5,4,3,2,1)
    cor.test(x, y, method = "spearman")


可見P值<0.05,拒絕原假設(shè),認(rèn)為x與y相關(guān),rs=-1,表示這兩個(gè)量是完全負(fù)相關(guān),即兩人的結(jié)論有關(guān)系,但完全相反。


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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機(jī)數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調(diào)用 initGeetest 進(jìn)行初始化 // 參數(shù)1:配置參數(shù) // 參數(shù)2:回調(diào),回調(diào)的第一個(gè)參數(shù)驗(yàn)證碼對(duì)象,之后可以使用它調(diào)用相應(yīng)的接口 initGeetest({ // 以下 4 個(gè)配置參數(shù)為必須,不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺(tái)檢測(cè)極驗(yàn)服務(wù)器是否宕機(jī) new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機(jī)時(shí)表示是新驗(yàn)證碼的宕機(jī) product: "float", // 產(chǎn)品形式,包括:float,popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請(qǐng)參見:http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計(jì)時(shí)完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請(qǐng)輸入'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var errTxt = '請(qǐng)輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }