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首頁(yè)大數(shù)據(jù)時(shí)代R語(yǔ)言隨機(jī)森林ROC曲線下的面積如何計(jì)算?
R語(yǔ)言隨機(jī)森林ROC曲線下的面積如何計(jì)算?
2023-04-13
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R語(yǔ)言中,計(jì)算隨機(jī)森林( Random Forest)的 ROC 曲線下面積是一項(xiàng)重要的任務(wù)。ROC曲線下面積也稱(chēng)為AUC(Area Under the Curve),用于評(píng)估分類(lèi)器的性能。在本文中,我們將介紹如何使用R語(yǔ)言計(jì)算隨機(jī)森林ROC曲線下面積,并解釋這個(gè)度量的意義。

首先,我們需要明確隨機(jī)森林的概念。隨機(jī)森林是一種集成學(xué)習(xí)方法,由多個(gè)決策樹(shù)組成。每個(gè)決策樹(shù)都是對(duì)數(shù)據(jù)集的一個(gè)子集進(jìn)行訓(xùn)練。然后,通過(guò)投票或平均值來(lái)確定最終的預(yù)測(cè)結(jié)果。與單個(gè)決策樹(shù)相比,隨機(jī)森林具有更高的準(zhǔn)確性和泛化能力。

接下來(lái),我們需要導(dǎo)入必要的R包并加載數(shù)據(jù)。在本例中,我們使用UCI Machine Learning Repository提供的Pima Indians Diabetes Database數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)集包括768個(gè)女性樣本,每個(gè)樣本有8個(gè)生理指標(biāo)以及是否患有糖尿病的標(biāo)簽。

library(randomForest)
library(ROCR)

# Load data
data <- read.csv("pima-indians-diabetes.csv")

然后,我們需要將數(shù)據(jù)分為訓(xùn)練集和測(cè)試集。在本例中,我們將80%的數(shù)據(jù)用于訓(xùn)練,20%的數(shù)據(jù)用于測(cè)試。

# Split data into training and testing sets
set.seed(123)
trainIndex <- sample(seq_len(nrow(data)), size = floor(0.8*nrow(data)), replace = FALSE)
trainData <- data[trainIndex, ]
testData <- data[-trainIndex,]

接下來(lái),我們將使用隨機(jī)森林模型進(jìn)行訓(xùn)練,并對(duì)測(cè)試數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)測(cè)。在本例中,我們使用了500個(gè)決策樹(shù)。

# Train random forest model
model <- randomForest(as.factor(diabetes)~., data=trainData, ntree=500)

# Predict on test set
predictions <- predict(model, testData)

然后,我們可以使用ROCR包中的prediction和performance函數(shù)計(jì)算ROC曲線AUC。首先,我們需要?jiǎng)?chuàng)建一個(gè)prediction對(duì)象,其中包括隨機(jī)森林模型的預(yù)測(cè)結(jié)果以及測(cè)試數(shù)據(jù)集的真實(shí)標(biāo)簽。

# Create prediction object
pred <- prediction(predictions, testData$diabetes)

然后,我們可以使用performance函數(shù)計(jì)算ROC曲線AUC

# Compute ROC curve and AUC
perf <- performance(pred, measure = "tpr", x.measure = "fpr")
auc <- performance(pred, measure = "auc")

現(xiàn)在我們可以使用plot函數(shù)繪制ROC曲線并顯示AUC值。

# Plot ROC curve
plot(perf, main = "ROC Curve - Random Forest", col="blue", lwd=2)

# Add diagonal line for comparison
abline(a=0, b=1, lwd=2, lty=2)

# Add legend
legend("bottomright", legend = paste("AUC =", round(auc@y.values[[1]], 3)), col="blue", lwd=2, bty="n")

最后,我們可以看到繪制的ROC曲線和計(jì)算出的AUC值。在本例中,AUC為0.792,這意味著分類(lèi)器具有適度的性能。

總之,在R語(yǔ)言中計(jì)算隨機(jī)森林ROC曲線下面積需要使用ROCR包中的prediction和performance函數(shù)。通過(guò)將預(yù)測(cè)結(jié)果和真實(shí)標(biāo)簽傳遞給prediction函數(shù),我們可以創(chuàng)建一個(gè)prediction對(duì)象。然后,利用performance函數(shù)就可以計(jì)算ROC曲線AUC值。這個(gè)度量是評(píng)估分類(lèi)器性能的重要指標(biāo),對(duì)于許多機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用程序都非常有用。

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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機(jī)數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調(diào)用 initGeetest 進(jìn)行初始化 // 參數(shù)1:配置參數(shù) // 參數(shù)2:回調(diào),回調(diào)的第一個(gè)參數(shù)驗(yàn)證碼對(duì)象,之后可以使用它調(diào)用相應(yīng)的接口 initGeetest({ // 以下 4 個(gè)配置參數(shù)為必須,不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶(hù)后臺(tái)檢測(cè)極驗(yàn)服務(wù)器是否宕機(jī) new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機(jī)時(shí)表示是新驗(yàn)證碼的宕機(jī) product: "float", // 產(chǎn)品形式,包括:float,popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說(shuō)明請(qǐng)參見(jiàn):http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計(jì)時(shí)完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請(qǐng)輸入'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var errTxt = '請(qǐng)輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'!'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }