
數(shù)值型數(shù)據(jù)的探索分析
數(shù)據(jù)分析過程中,往往需要對(duì)數(shù)據(jù)作基本的探索性分析,查看數(shù)據(jù)是否存在問題,如缺失值數(shù)量、是否存在明顯的異常值、數(shù)據(jù)是如何分布的、數(shù)據(jù)的集中趨勢(shì)和離散趨勢(shì)等。
探索性分析一般包括三大部分,即數(shù)據(jù)的分布情況、數(shù)據(jù)的集中與離散趨勢(shì)和數(shù)據(jù)的分布形態(tài):
首先來看看關(guān)于數(shù)據(jù)分布情況的探索性分析。一般統(tǒng)計(jì)中通過5數(shù)就可以大致了解數(shù)據(jù)的分布,他們是最小值、下四分位數(shù)、中位數(shù)、上四分位數(shù)和最大值。
其次看看數(shù)據(jù)的集中趨勢(shì)和離散趨勢(shì),通過集中趨勢(shì)可以了解數(shù)據(jù)的中心值或代表值,通過離散趨勢(shì)可以了解數(shù)據(jù)遠(yuǎn)離中心的程度。關(guān)于集中趨勢(shì),一般可使用均值、眾數(shù)、中位數(shù)來衡量,離散趨勢(shì)一般通過標(biāo)準(zhǔn)差、極差和四分位差來體現(xiàn)。
最后看看數(shù)據(jù)的分布形態(tài),數(shù)據(jù)的分布形態(tài)無非是相比于正態(tài)分布而言,即偏度和峰度。偏度是數(shù)據(jù)分布形態(tài)呈現(xiàn)左偏或右偏;峰度是數(shù)據(jù)分布形態(tài)呈現(xiàn)尖瘦或矮胖。對(duì)于偏度和峰度需要說明的是:若偏度=0,則無偏;若偏度>0,則有偏;若偏度<0,則左偏;若峰度=0,則陡峭程度與正態(tài)分布一致;如峰度>0,則分布陡峭;若峰度<0,則分布平緩。
下面從定量和定性的角度看觀察數(shù)據(jù)的探索性分析過程:
自定義函數(shù)describe_statistics,函數(shù)返回變量的觀測(cè)數(shù)目、缺失值數(shù)目、最小值、下四分位數(shù)、中位數(shù)、上四分位數(shù)、最大值、均值、眾數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、極差、四分位差、偏度和峰度。這里的自定義函數(shù)返回結(jié)果類似于SAS的輸出結(jié)果形態(tài):
```{r}
describe_statistics <- function(x){
options(digits = 3)
require(timeDate);
N = length(x);
Nmiss = sum(is.na(x));
Min = min(x, na.rm = TRUE);
Q1 = quantile(x, probs = 0.25, na.rm = TRUE);
Median = median(x, na.rm = TRUE);
Q3 = quantile(x, probs = 0.75, na.rm = TRUE);
Max = max(x, na.rm = TRUE);
Mean = mean(x, na.rm = TRUE);
Mode = as.numeric(names(table(x)))[which.max(table(x))];
Sd = sd(x, na.rm = TRUE);
Range = abs(diff(range(x)));
QRange = IQR(x, na.rm = TRUE);
Skewness = skewness(x, na.rm = TRUE);
Kurtosis = kurtosis(x, na.rm = TRUE);
#返回函數(shù)結(jié)果
return(data.frame(N = N, Nmiss = Nmiss, Min = Min, Q1 = Q1, Median = Median, Q3 = Q3, Max = Max, Mean = Mean, Mode = Mode, Sd = Sd, Range = Range, QRange = QRange, Skewness = Skewness, Kurtosis = Kurtosis))
}
```
下面我們就用這個(gè)自定義函數(shù)來測(cè)試一下,通過上面的這些統(tǒng)計(jì)量值來探索數(shù)據(jù)分布、集中趨勢(shì)、離散趨勢(shì)和分布形態(tài)。由于本文講解的是數(shù)值型數(shù)據(jù)的探索分析,故需要將數(shù)據(jù)框中的數(shù)值型數(shù)據(jù)挑選出來,仍然自定義函數(shù),返回?cái)?shù)據(jù)框中所有數(shù)值型數(shù)據(jù)的字段:
```{r}
Value_Variables <- function(df){
Vars <- names(df)[sapply(df,class) == 'integer' | sapply(df,class) == 'numeric']
return(Vars)
}
```
以R中自帶的iris數(shù)據(jù)集測(cè)試:
```{r}
vars <- Value_Variables(iris)
res <- sapply(iris[,vars], describe_statistics)
res
```
上面的結(jié)果呈現(xiàn)了鳶尾花四個(gè)數(shù)值型變量的探索性分析。
以C50包中的churnTrain數(shù)據(jù)集測(cè)試:
```{r}
library(C50)
data(churn)
vars <- Value_Variables(churnTrain)
res <- sapply(churnTrain[,vars], describe_statistics)
res
```
很顯然,當(dāng)變量很多時(shí),這樣的返回結(jié)果讓人看的很難受,如要使輸出結(jié)果便讀的話,可以將返回結(jié)果轉(zhuǎn)置:
```{r}
t(res)
```
這會(huì)結(jié)果要比較整齊,好看。
以上是從定量的角度來探索數(shù)據(jù)的分布、集中趨勢(shì)、離散趨勢(shì)和分布形態(tài),下面我們簡(jiǎn)單介紹一下定性的方法。
從定性角度,即通過可視化來進(jìn)行數(shù)據(jù)的探索性分析,強(qiáng)烈推薦使用GGally包中的ggpairs()函數(shù),該函數(shù)將繪制兩兩變量的相關(guān)系數(shù)、散點(diǎn)圖,同時(shí)也繪制出單變量的密度分布圖:
```{r}
library(GGally)
vars <- Value_Variables(iris)
ggpairs(iris[,vars])
```
上圖不僅僅反映了數(shù)據(jù)的分布情況、還得出兩兩變量間的散點(diǎn)圖和相關(guān)系數(shù),可為下一步分析做鋪墊。
數(shù)據(jù)的探索性分析過程中,通過定量和定性方法的搭配,可使分析者快速的了解數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)、分布及內(nèi)在關(guān)系。
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