
作者:丁點(diǎn)helper
來(lái)源:丁點(diǎn)幫你
前面兩篇文章初步介紹了生存分析基本入門(mén)的內(nèi)容,今天我們來(lái)看看實(shí)際應(yīng)用中怎么估計(jì)生存率。具體的方法和術(shù)語(yǔ)我們先不講,首先來(lái)看例子。
案例:為了解肺癌患者接受某種治療后的生存狀況,研究者收集了12名肺癌患者手術(shù)加化療的住院資料。他們的生存時(shí)間(月)分別為:2, 5, 8, 9, 9+, 10, 13, 13, 15+, 18, 20, 23+。
試問(wèn),采用該治療方案的12名患者的術(shù)后生存率如何?(案例來(lái)自相關(guān)教科書(shū),有刪改)
如何來(lái)評(píng)判這種治療方法的生存率呢?我們從“生存數(shù)據(jù)”入手,關(guān)于生存數(shù)據(jù)的詳細(xì)解釋大家可以看第一篇文章。
今天的文章我們來(lái)一步步搞懂上面這張表。
案例中介紹了,一共有12名住院患者,他們的生存時(shí)間(用 t 表示)分別為:2, 5, 8, 9, 9+, 10, 13, 13, 15+, 18, 20, 23+,單位是月。第一個(gè)問(wèn)題,有些數(shù)字有加號(hào),有些沒(méi)有,是為什么呢?
有加號(hào)的表示,該數(shù)據(jù)是“刪失數(shù)據(jù)”,什么是刪失數(shù)據(jù)?(以及什么是完全數(shù)據(jù)?)可以看第一篇文章。這里簡(jiǎn)單理解就是,患者失聯(lián)了,后續(xù)的信息無(wú)法獲取。
比如上面的生存時(shí)間數(shù)據(jù)中有一個(gè)“9+”,可以理解為,跟蹤了9個(gè)月,患者一直存活且保持著聯(lián)系,可是當(dāng)下一次(比如第10個(gè)月開(kāi)始)去找他的時(shí)候(專(zhuān)業(yè)名詞叫“隨訪”),找不到了,說(shuō)的不好聽(tīng)一點(diǎn),是死是活不知道。
因此,對(duì)于這樣的數(shù)據(jù),我們就叫“刪失數(shù)據(jù)”。由于患者確實(shí)可能還活著,只是失聯(lián),謹(jǐn)慎起見(jiàn),我們就在上一次隨訪的數(shù)據(jù)“9”后面加一個(gè)“+”,表示他存活的時(shí)間可能長(zhǎng)于9個(gè)月。
其他的刪失數(shù)據(jù)也這樣理解。搞懂刪失后,我們?cè)賮?lái)看這個(gè)表。表格的第(1)列序號(hào)代表什么呢?排序的號(hào)碼!
將上面12名患者的生存時(shí)間t 從小到大排序并編號(hào)。
——注意兩點(diǎn):
第一,完全數(shù)據(jù)和刪失數(shù)據(jù)要用不同的編號(hào),比如上面的“9”和“9+”一個(gè)是編號(hào)“4”,一個(gè)是編號(hào)“5”,完全數(shù)據(jù)列在刪失數(shù)據(jù)前面;
第二,其他情況下,相同的生存時(shí)間編號(hào)相同,比如上面有兩個(gè)“13”,所以都編為“7”。
編號(hào)完成后,就把相應(yīng)的生存時(shí)間排進(jìn)去,見(jiàn)上表第(2)列。
這里大家需要熟悉一些表達(dá),比如t?=2、t?=5 ... 就是指隨訪的第一個(gè)時(shí)間點(diǎn)是2個(gè)月,隨訪的第二個(gè)時(shí)間點(diǎn)是第5個(gè)月。
接著往后看,第(3)列是“死亡例數(shù)”,就是指在這個(gè)時(shí)間段的死亡人數(shù)是多少?
比如在第一個(gè)時(shí)間段內(nèi)( t?=2 )有1名患者死亡,就表示為:d?=1;
同理,在第二個(gè)時(shí)間段內(nèi)也有1名死亡(注意是: t?~ t?,就是2月末到第5月末),表示為:d?=1;
后續(xù)依次類(lèi)推,這里需要注意的是,“死亡例數(shù)”記錄的是某個(gè)特定的時(shí)間段內(nèi)的死亡人數(shù),不是累計(jì)的死亡人數(shù)。
表格中第(4)列稱(chēng)作“刪失數(shù)據(jù)”,就是記錄那些帶“+”號(hào)的數(shù)據(jù)的,可以發(fā)現(xiàn),上面每一個(gè)刪失數(shù)據(jù)都單獨(dú)做一例錄入。
第(5)列“期初人數(shù)”就與上面“死亡例數(shù)”相對(duì)應(yīng),就是指這個(gè)觀察期開(kāi)始時(shí)的人數(shù)。
第一個(gè)數(shù)( n?)是“12”,就表示剛開(kāi)始觀察的人數(shù)是12人。
隨著觀察時(shí)間的延長(zhǎng),有患者死亡,就算作是一期。比如,到第2月末時(shí),有1名患者死亡,那么下一個(gè)觀察期的“期初人數(shù)”就是 12-1 = 11,因此: n?=11,到第5月末時(shí),又一名患者死亡,第3期(i = 3)“期初人數(shù)”就是 11-1 = 10,表示為: n?=10。
后面的以此類(lèi)推,由此我們可以得出一個(gè)計(jì)算公式:
后面兩列——死亡概率和生存概率也很好理解,只有一點(diǎn),就是要明白這里計(jì)算的概率都是以一期為單位的,而不是累積的。
比如第一期( i=1),一名患者死亡,所以,死亡概率就是:1/12;對(duì)應(yīng)的生存概率就是:1-1/12。
第二期( i=2),也有一名患者死亡,死亡概率:1/11; 生存概率:1-1/11。
需要注意,這里的分母變成了11。原因還是:這里是以每一期為一個(gè)單位,計(jì)算時(shí),都以該期的“期初人數(shù)”為分母。
搞清楚了死亡概率和生存概率,終于迎來(lái)了我們的主角“生存率”。
這個(gè)生存率怎么計(jì)算?很簡(jiǎn)單,就是各期生存概率的乘積。
后面的依次類(lèi)推,就是這么簡(jiǎn)單。
我們來(lái)驗(yàn)算一下,比如:
用計(jì)算器算一下,這個(gè)也可以口算,你發(fā)現(xiàn)了么?
至于為什么這里都要加一個(gè)“ ^ ”以及上表中最后一列“生存率的標(biāo)準(zhǔn)誤”怎么理解和計(jì)算,我們留到下一篇文章。
以上我們估算生存率的方法教科書(shū)稱(chēng)為:Kaplan-Meier法,又稱(chēng)乘積極限法,可以簡(jiǎn)單記為K-M法。
其基本思想是:將所有觀察對(duì)象的生存時(shí)間(包括刪失數(shù)據(jù))由小到大依次排列,對(duì)每個(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行死亡概率、生存概率和生存率的估計(jì)。
回顧上面的文章,是否就是這個(gè)過(guò)程呢?
K-M法一般用于觀察對(duì)象數(shù)目較少的沒(méi)有進(jìn)行特定分組的資料(如同本例)。這樣可以能夠充分利用每條記錄的信息,估計(jì)不同生存時(shí)間點(diǎn)的生存率。
以上就是今天的內(nèi)容。我們可以看到,實(shí)際應(yīng)用中生存率的計(jì)算并不難,就是幾個(gè)概率相乘。
學(xué)習(xí)起來(lái)真正的難點(diǎn)是一整套數(shù)據(jù)的記錄和整理方法,而且還出現(xiàn)“刪失”這種看起來(lái)就頭大的術(shù)語(yǔ)。
所以,處理生存分析,首先要按照我們今天文章的梳理過(guò)程,一步一步弄懂每一個(gè)的指標(biāo)的意義,生存率的估計(jì)就水到渠成了。
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