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R語言之主成分分析_用R語言寫主成分分析的代碼
2016-12-10
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R語言之主成分分析_用R語言寫主成分分析的代碼

1、關(guān)鍵點(diǎn)

綜述：主成分分析 因子分析 典型相關(guān)分析，三種方法的共同點(diǎn)主要是用來對(duì)數(shù)據(jù)降維處理的 從數(shù)據(jù)中提取某些公共部分，然后對(duì)這 些公共部分進(jìn)行分析和處理。
#主成分分析 是將多指標(biāo)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)的一種統(tǒng)計(jì)分析方法

主成分分析是一種通過降維技術(shù)把多個(gè)變量化成少數(shù)幾個(gè)主成分的方法，這些主成分能夠反映原始變量的大部分信息，他們通常表示為原始變量的線性組合。

2、函數(shù)總結(jié)

#R中作為主成分分析最主要的函數(shù)是princomp()函數(shù)
#princomp()主成分分析   可以從相關(guān)陣或者從協(xié)方差陣做主成分分析
#summary()提取主成分信息 
#loadings()顯示主成分分析或因子分析中載荷的內(nèi)容
#predict()預(yù)測主成分的值 
#screeplot()畫出主成分的碎石圖 
#biplot()畫出數(shù)據(jù)關(guān)于主成分的散點(diǎn)圖和原坐標(biāo)在主成分下的方向

3、案例

#現(xiàn)有30名中學(xué)生身高、體重、胸圍、坐高數(shù)據(jù)，對(duì)身體的四項(xiàng)指標(biāo)數(shù)據(jù)做主成分分析。

#1.載入原始數(shù)據(jù)
test<-data.frame(
X1=c(148, 139, 160, 149, 159, 142, 153, 150, 151, 139,
          140, 161, 158, 140, 137, 152, 149, 145, 160, 156,
          151, 147, 157, 147, 157, 151, 144, 141, 139, 148),
X2=c(41, 34, 49, 36, 45, 31, 43, 43, 42, 31,
          29, 47, 49, 33, 31, 35, 47, 35, 47, 44,
          42, 38, 39, 30, 48, 36, 36, 30, 32, 38),
X3=c(72, 71, 77, 67, 80, 66, 76, 77, 77, 68,
         64, 78, 78, 67, 66, 73, 82, 70, 74, 78,
         73, 73, 68, 65, 80, 74, 68, 67, 68, 70),
X4=c(78, 76, 86, 79, 86, 76, 83, 79, 80, 74,
          74, 84, 83, 77, 73, 79, 79, 77, 87, 85,
          82, 78, 80, 75, 88, 80, 76, 76, 73, 78)
)

#2.作主成分分析并顯示分析結(jié)果
test.pr<-princomp(test,cor=TRUE)  #cor是邏輯變量 當(dāng)cor=TRUE表示用樣本的相關(guān)矩陣R做主成分分析

當(dāng)cor=FALSE表示用樣本的協(xié)方差陣S做主成分分析
summary(test.pr,loadings=TRUE)  #loading是邏輯變量 當(dāng)loading=TRUE時(shí)表示顯示loading 的內(nèi)容

#loadings的輸出結(jié)果為載荷 是主成分對(duì)應(yīng)于原始變量的系數(shù)即Q矩陣

分析結(jié)果含義
#—-Standard deviation 標(biāo)準(zhǔn)差   其平方為方差=特征值
#—-Proportion of Variance  方差貢獻(xiàn)率
#—-Cumulative Proportion  方差累計(jì)貢獻(xiàn)率
#由結(jié)果顯示 前兩個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率已經(jīng)達(dá)到96% 可以舍去另外兩個(gè)主成分 達(dá)到降維的目的

因此可以得到函數(shù)表達(dá)式 Z1=-0.497X’1-0.515X’2-0.481X’3-0.507X’4

Z1=  0.543X’1-0.210X’2-0.725X’3-0.368X’4

#4.畫主成分的碎石圖并預(yù)測

screeplot(test.pr,type=”lines”)

p<-predict(test.pr)

由碎石圖可以看出 第二個(gè)主成分之后 圖線變化趨于平穩(wěn) 因此可以選擇前兩個(gè)主成分做分析


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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機(jī)數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調(diào)用 initGeetest 進(jìn)行初始化 // 參數(shù)1：配置參數(shù) // 參數(shù)2：回調(diào)，回調(diào)的第一個(gè)參數(shù)驗(yàn)證碼對(duì)象，之后可以使用它調(diào)用相應(yīng)的接口 initGeetest({ // 以下 4 個(gè)配置參數(shù)為必須，不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺(tái)檢測極驗(yàn)服務(wù)器是否宕機(jī) new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機(jī)時(shí)表示是新驗(yàn)證碼的宕機(jī) product: "float", // 產(chǎn)品形式，包括：float，popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請(qǐng)參見：http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計(jì)時(shí)完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請(qǐng)輸入'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var errTxt = '請(qǐng)輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }