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使用R完成Kmeans聚類
2016-02-03
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使用R完成Kmeans聚類

當(dāng)前，大數(shù)據(jù)分析等技術(shù)浪潮兇猛來襲，正在加速各類數(shù)據(jù)分析師對(duì)數(shù)據(jù)分析技術(shù)的提高。那么，數(shù)據(jù)分析師到底如何有效迎接呢，就拿R語言來說吧，如何用R語言完成kmemnsne,下面就說一下！

newiris <- iris;
newiris$Species <- NULL; #對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)去掉分類標(biāo)記
kc <- kmeans(newiris, 3); #分類模型訓(xùn)練
fitted(kc); #查看具體分類情況
table(iris$Species, kc$cluster); #查看分類概括

#聚類結(jié)果可視化
plot(newiris[c(“Sepal.Length”, “Sepal.Width”)], col = kc$cluster, pch = as.integer(iris$Species)); #不同的顏色代表不同的聚類結(jié)果，不同的形狀代表訓(xùn)練數(shù)據(jù)集的原始分類情況。
points(kc$centers[,c(“Sepal.Length”, “Sepal.Width”)], col = 1:3, pch = 8, cex=2);

聚類結(jié)果可視化圖如下

2014040718414864

數(shù)據(jù)分析師:R幫助文檔中有一個(gè)非常好的例子，如下，特別留意kmeans方法滿足的條件：

require(graphics)

# a 2-dimensional example
x <- rbind(matrix(rnorm(100, sd = 0.3), ncol = 2),
matrix(rnorm(100, mean = 1, sd = 0.3), ncol = 2))
colnames(x) <- c(“x”, “y”)
(cl <- kmeans(x, 2))
plot(x, col = cl$cluster)
points(cl$centers, col = 1:2, pch = 8, cex = 2)

# sum of squares
# 其中scale函數(shù)提供數(shù)據(jù)中心化功能，所謂數(shù)據(jù)的中心化是指數(shù)據(jù)集中的各項(xiàng)數(shù)據(jù)減去數(shù)據(jù)集的均值，這個(gè)函數(shù)還提供數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化功能，所謂數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化是指中心化之后的數(shù)據(jù)在除以數(shù)據(jù)集的標(biāo)準(zhǔn)差，即數(shù)據(jù)集中的各項(xiàng)數(shù)據(jù)減去數(shù)據(jù)集的均值再除以數(shù)據(jù)集的標(biāo)準(zhǔn)差。見http://it.zhans.org/10/1834.htm。
ss <- function(x) sum(scale(x, scale = FALSE)^2)

## cluster centers “fitted” to each obs.:
fitted.x <- fitted(cl);
head(fitted.x);
resid.x <- x – fitted(cl);

## Equalities : ———————————-
cbind(cl[c(“betweenss”, “tot.withinss”, “totss”)], # the same two columns
c(ss(fitted.x), ss(resid.x), ss(x)))
# kmeas聚類滿足如下條件
stopifnot(all.equal(cl$ totss, ss(x)),
all.equal(cl$ tot.withinss, ss(resid.x)),
## these three are the same:
all.equal(cl$ betweenss, ss(fitted.x)),
all.equal(cl$ betweenss, cl$totss – cl$tot.withinss),
## and hence also
all.equal(ss(x), ss(fitted.x) + ss(resid.x))
)cda數(shù)據(jù)分析師培訓(xùn)

聚類結(jié)果可視化圖如下

2014040719305934


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') } function initGt() { var handler = function (captchaObj) { captchaObj.appendTo('#captcha'); captchaObj.onReady(function () { $("#wait").hide(); }).onSuccess(function(){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); $('.getcheckcode').trigger('click'); }); window.captchaObj = captchaObj; }; $('#captcha').show(); $.ajax({ url: "/login/gtstart?t=" + (new Date()).getTime(), // 加隨機(jī)數(shù)防止緩存 type: "get", dataType: "json", success: function (data) { $('#text').hide(); $('#wait').show(); // 調(diào)用 initGeetest 進(jìn)行初始化 // 參數(shù)1：配置參數(shù) // 參數(shù)2：回調(diào)，回調(diào)的第一個(gè)參數(shù)驗(yàn)證碼對(duì)象，之后可以使用它調(diào)用相應(yīng)的接口 initGeetest({ // 以下 4 個(gè)配置參數(shù)為必須，不能缺少 gt: data.gt, challenge: data.challenge, offline: !data.success, // 表示用戶后臺(tái)檢測(cè)極驗(yàn)服務(wù)器是否宕機(jī) new_captcha: data.new_captcha, // 用于宕機(jī)時(shí)表示是新驗(yàn)證碼的宕機(jī) product: "float", // 產(chǎn)品形式，包括：float，popup width: "280px", https: true // 更多配置參數(shù)說明請(qǐng)參見：http://docs.geetest.com/install/client/web-front/ }, handler); } }); } function codeCutdown() { if(_wait == 0){ //倒計(jì)時(shí)完成 $(".getcheckcode").removeClass('dis').html("重新獲取"); }else{ $(".getcheckcode").addClass('dis').html("重新獲取("+_wait+"s)"); _wait--; setTimeout(function () { codeCutdown(); },1000); } } function inputValidate(ele,telInput) { var oInput = ele; var inputVal = oInput.val(); var oType = ele.attr('data-type'); var oEtag = $('#etag').val(); var oErr = oInput.closest('.form_box').next('.err_txt'); var empTxt = '請(qǐng)輸入'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var errTxt = '請(qǐng)輸入正確的'+oInput.attr('placeholder')+'！'; var pattern; if(inputVal==""){ if(!telInput){ errFun(oErr,empTxt); } return false; }else { switch (oType){ case 'login_mobile': pattern = /^1[3456789]\d{9}$/; if(inputVal.length==11) { $.ajax({ url: '/login/checkmobile', type: "post", dataType: "json", data: { mobile: inputVal, etag: oEtag, page_ur: window.location.href, page_referer: document.referrer }, success: function (data) { } }); } break; case 'login_yzm': pattern = /^\d{6}$/; break; } if(oType=='login_mobile'){ } if(!!validateFun(pattern,inputVal)){ errFun(oErr,'') if(telInput){ $('.getcheckcode').removeClass('dis'); } }else { if(!telInput) { errFun(oErr, errTxt); }else { $('.getcheckcode').addClass('dis'); } return false; } } return true; } function errFun(obj,msg) { obj.html(msg); if(msg==''){ $('.login_submit').removeClass('dis'); }else { $('.login_submit').addClass('dis'); } } function validateFun(pat,val) { return pat.test(val); }