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大數(shù)據(jù)引導生物醫(yī)學變革
2017-08-12
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大數(shù)據(jù)引導生物醫(yī)學變革

大數(shù)據(jù)影響的深度和廣度仍在不斷擴張。對于生物醫(yī)學來說,其發(fā)展過程中積淀的數(shù)據(jù)資源,是大數(shù)據(jù)時代的基礎之一。而大數(shù)據(jù)的挖掘和應用,反過來也在引發(fā)著生物醫(yī)學的變革。

在此次論壇上,專家們圍繞“大數(shù)據(jù)在醫(yī)學科技創(chuàng)新中的應用”這一話題,進行了深入的交流探討。與會專家指出,生物大數(shù)據(jù)已經成為歐美國家重要的發(fā)展戰(zhàn)略,而我國生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)開發(fā)同發(fā)達國家尚有一定差距,亟須加強相關研究和投入。

大數(shù)據(jù)引發(fā)醫(yī)學研究變革

“大數(shù)據(jù)是大趨勢,使得生產資料中首次出現(xiàn)了非物質成分:數(shù)據(jù)。世界正在由資本經濟時代向數(shù)據(jù)經濟時代過渡,數(shù)據(jù)及其服務成為國家戰(zhàn)略和經濟的基礎設施?!避娛箩t(yī)學科學院研究員朱云平長期從事生物信息學綜合數(shù)據(jù)庫及平臺建設研究,在他看來,生物和醫(yī)療領域已成為重要的大數(shù)據(jù)領域。

中國工程院院士、中日友好醫(yī)院院長王辰指出,大數(shù)據(jù)時代的來臨,加上轉化醫(yī)學的興起,在我國形成了歷史性契機,可望使中國醫(yī)學研究實現(xiàn)歷史性跨越。

首都醫(yī)科大學附屬北京安貞醫(yī)院心臟內科中心主任馬長生正在承擔“北京市心血管疾病防控大數(shù)據(jù)平臺建設”的工作,在他的研究中,包括用大數(shù)據(jù)手段研究環(huán)境和心血管疾病的關系。“用大數(shù)據(jù)的手段,每日不同站點PM2.5濃度與心血管疾病的關系,甚至股票波動與心血管疾病的關系,都可以得到預測?!?

“美國發(fā)布的年度癌腫報告,其實是一份惡性腫瘤大數(shù)據(jù)分析報告?!敝袊t(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院副院長王綠化介紹,中國正在建設腦腫瘤大數(shù)據(jù)平臺,旨在提供數(shù)據(jù)樣本資源庫,同時為八大腫瘤建立知識庫和分析庫。

而事實上,大數(shù)據(jù)不僅為生物醫(yī)學研究帶來了新的技術手段,還具有大規(guī)模降低醫(yī)療費用的潛在效益。根據(jù)美國BCC research公司研究顯示,僅就與高通量測序相關的組學大數(shù)據(jù)而言,至2018年,其市場總額將增長至76億美元,復合年增長率達到71%。麥肯錫全球研究院報告,如果美國醫(yī)療保健行業(yè)對大數(shù)據(jù)進行有效利用,就能把成本降低8%左右,從而每年創(chuàng)造出超過3000億美元的產值。

發(fā)達國家經驗與挑戰(zhàn)

大數(shù)據(jù)科學與產業(yè)具有較強的領域相關性,生物大數(shù)據(jù)已經成為歐美國家重要的發(fā)展戰(zhàn)略,也是美國國家大數(shù)據(jù)計劃的重要組成部分。

朱云平介紹,歐美主導的國際生命科學計劃產生的數(shù)據(jù)和知識,已成為重要的國家資源。例如國際人類基因組單體型圖計劃、DNA元件百科全書計劃、人類表觀基因組計劃、國際癌基因組計劃、千人基因組計劃等,這些計劃形成的數(shù)據(jù)資源潛在價值十分巨大。

2009年,美國出臺HITECH法案,將醫(yī)療衛(wèi)生信息化列為重點發(fā)展方向,十年內累計投入2760億美元。加拿大也在規(guī)劃EHRS藍圖,旨在全面推進國家醫(yī)療信息化、電子監(jiān)控檔案建設。英國10年內投入超過120億英鎊,用于建設全國一體化的醫(yī)療信息系統(tǒng)。歐盟則發(fā)力統(tǒng)一的e-health體系建設,10年投入超過60億歐元。

但在我國,卻存在缺失生物數(shù)字主權的尷尬。近年來中國學者在國外發(fā)表了眾多學術論文,在發(fā)文章時,需要先把數(shù)據(jù)傳輸給國外雜志社?!霸趪獍l(fā)表文章后,名義上是說可以獲得數(shù)據(jù)共享,但中國學者需要的許多數(shù)據(jù)并不是想拿就能拿到的。”朱云平說。

朱云平指出,我國醫(yī)療數(shù)據(jù)幾乎不能共享,轉化利用率低。而美國目前已經初步實現(xiàn)了社區(qū)、醫(yī)院、區(qū)域的醫(yī)療數(shù)據(jù)共享系統(tǒng)?,F(xiàn)實導致我國缺少自主知識產權的高價值生物數(shù)據(jù)庫,且我國生物大數(shù)據(jù)分析能力嚴重不足。

這使得中國學者在使用國外數(shù)據(jù)時,必須支付高昂的費用。例如,世界最為權威的代謝通路數(shù)據(jù)庫KEGG,其使用費為每年5000美元。權威的人類疾病相關變異數(shù)據(jù)庫HGMD,其年費是3725美元。權威的藥物基因組變異與藥物反應數(shù)據(jù)庫PGMD,其年費也達3735美元。

生物大數(shù)據(jù)事關國家未來戰(zhàn)略

去年9月谷歌公司宣布成立Calico公司,利用大數(shù)據(jù)進行人類衰老及相關疾病方面的研究。亞馬遜通過其云平臺托管國際千人基因組計劃龐大數(shù)據(jù)庫,并免費開放。微軟也啟動了microsoft biology initiative項目,進軍生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)領域。據(jù)悉,美國已建成覆蓋本土的12個區(qū)域電子病歷數(shù)據(jù)中心、9個醫(yī)療知識中心和8個醫(yī)學影像與生物信息數(shù)據(jù)中心。

但是,我國生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)產業(yè)尚未形成。朱云平說,我國迫切需要建立國家級生物大數(shù)據(jù)技術研發(fā)基地。

所幸的是,國家“863”計劃2015年度項目申報指南中,在生物和醫(yī)藥技術領域已經部署“生物大數(shù)據(jù)開發(fā)與利用關鍵技術研究”,涉及的內容包括生物大數(shù)據(jù)標準化和集成、融合技術,生物大數(shù)據(jù)表述索引、搜索與存儲訪問技術,心血管疾病和腫瘤疾病大數(shù)據(jù)處理分析與應用研究,機遇區(qū)域醫(yī)療與健康大數(shù)據(jù)處理分析與應用研究,組學大數(shù)據(jù)中心和知識庫構建與服務技術等。

“生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)開發(fā)與利用,應面向我國生物數(shù)據(jù)匯集、管理、共享與利用的重大需求,重點突破生物大數(shù)據(jù)質量控制、集成融合、索引組織、存儲管理、搜索訪問、數(shù)據(jù)可視化、分析建模、知識庫構建等關鍵技術?!敝煸破浇ㄗh。

加強專業(yè)人才培養(yǎng)也尤為迫切。王辰指出,為適應生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)的發(fā)展,應在生物醫(yī)學領域加強計算機科學、數(shù)據(jù)庫專業(yè)人員的培養(yǎng),加強流行病學、統(tǒng)計分析、信息學人員、標本庫管理人員的培養(yǎng)。

不過,生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)也存在一定的風險。大數(shù)據(jù)中心的可靠性和隱私保護是其中的關鍵。

“數(shù)據(jù)中心崩潰的風險,可以通過在不同地域、不同條件下進行生物大數(shù)據(jù)存儲,再進行協(xié)同整合來解決。但在生物大數(shù)據(jù)的分析應用中,需要收集一切已知的生物信息,這與隱私保護存在沖突?!敝煸破秸J為,如何在應用生物大數(shù)據(jù)的同時,更好地保護個人隱私信息,需要深入研究。


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