
生命大數(shù)據(jù)將進入尋常百姓生活
人的一生,簡單的講,不外乎“生老病死”。我們能抗爭的、個體差異最大的就是“病”了。幾千年文化、知識、技術、經(jīng)驗的累積,人類對自身健康狀況的了解以及疾病干預的能力都大大提高。然而,我們對自身健康的掌控能力離預期還遠遠不夠,面對各類疾病缺少深入的了解、精細的分類和有針對性的治療。
旨在正確的時間,給正確的人,使用正確的藥物的“精準醫(yī)療”應運而生。獲取和掌握組學、臨床信息等生命大數(shù)據(jù)里包含的海量信息是醫(yī)療邁向精準的重要前提。生命大數(shù)據(jù)的累積和挖掘?qū)⒅鸩浇沂窘】蹬c疾病的全景關聯(lián)圖。
生命大數(shù)據(jù)支撐精準醫(yī)學研究
人類基因組計劃(human genome project,HGP)、基因組單體型圖計劃(hapmapproject)、全基因組關聯(lián)分析(genome-wide association study,GWAS)、DNA元件百科全書(encyclopedia of DNA elements,ENCODE)、表觀路線圖(NIH roadmap epigenomics)等大型組學計劃的順利完成,帶動了生命科學領域的重大變革。
高通量測序、高性能質(zhì)譜等組學技術得以快速發(fā)展,生命科學研究產(chǎn)生了大量有價值的包括基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學等在內(nèi)的“生物大數(shù)據(jù)”。整合分析多重組學數(shù)據(jù)和臨床資料,構建健康與疾病的知識網(wǎng)絡,將有望對疾病發(fā)展和不同病理狀態(tài)進行更加準確的分類,為不同遺傳背景的患者提供個體化診斷及精準治療。
很顯然,科學家們都已經(jīng)意識到各類生命大數(shù)據(jù)的重要作用。然而,以上重要的大型組學計劃均由歐美國家發(fā)起,獲得的數(shù)據(jù)主要基于歐美人群。中國人口眾多,遺傳背景與歐美人群有較大差異。實現(xiàn)中國人民的精準醫(yī)療,則需要中國人群的生命大數(shù)據(jù)來推動。
中科院在2015年啟動重點部署項目“中國人群精準醫(yī)學研究計劃”,將在4年內(nèi)完成4000名志愿者的DNA樣本和多種表現(xiàn)型數(shù)據(jù)的采集,并對其中2000人進行深入的精準醫(yī)學研究,包括全基因組序列分析,建立基因組健康檔案,針對一些重要慢性病的遺傳信號開展疾病風險和藥物反應的預警和干預研究。這些數(shù)據(jù)將會成為非常寶貴的中國人群遺傳信息資源。
科技部于2016年3月8日公布《關于發(fā)布國家重點研發(fā)計劃精準醫(yī)學研究等重點專項2016年度項目申報指南的通知》,拉開了精準醫(yī)療重大專項科研行動的序幕。本年度的科研專項包括構建百萬人以上的自然人群國家大型健康隊列和重大疾病專病隊列,建立生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)共享平臺等。
在國家戰(zhàn)略需求層面,生命大數(shù)據(jù)研究正如火如荼的開展起來,為精準醫(yī)學研究打下基礎。這一系列大數(shù)據(jù)項目的開展,將建設一套符合我國國情的生命大數(shù)據(jù)的獲取、分析、存儲、使用等規(guī)范;多個與健康相關的中國人群生命大數(shù)據(jù)知識庫;面向科研人員和醫(yī)務工作者的友好共享數(shù)據(jù)平臺等等?;谶@些大數(shù)據(jù)挖掘生命動態(tài)規(guī)律,將是通向精準醫(yī)療的重要基石。
綜合組學大數(shù)據(jù)和臨床大數(shù)據(jù)挖掘生命規(guī)律
生命大數(shù)據(jù)包含的種類繁多,包括基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表觀組、宏基因組等各類組學數(shù)據(jù)和影像、生化指標、標型特征等各類臨床數(shù)據(jù)。我國各類組學數(shù)據(jù)主要產(chǎn)生于科研院所和高校,臨床數(shù)據(jù)主要來源于各類醫(yī)療機構。
整合多類數(shù)據(jù),挖掘深層機制無疑是行之有效的方法。過去的整合分析主要是限于各類組學數(shù)據(jù)內(nèi)部,例如綜合組蛋白修飾數(shù)據(jù)、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和染色質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)篩查全基因組范圍內(nèi)的順式作用元件。當面對精準醫(yī)療,需要明確疾病的不同亞型及對應的分子機制,以及合適的治療方案,大數(shù)據(jù)在整合分析、挖掘時則必須要加上臨床大數(shù)據(jù)。
在2016年,多家科研機構和醫(yī)療機構聯(lián)合起來,共同攻關生命大數(shù)據(jù):
中科院北京基因組研究所聯(lián)合中科院生物物理研究所、浙江大學、復旦大學、國家衛(wèi)計委信息統(tǒng)計中心、北大人民醫(yī)院、中南大學湘雅醫(yī)院系統(tǒng)等構建精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)處理和利用的標準化技術體系。
軍事醫(yī)學科學院放射與輻射醫(yī)學研究所聯(lián)合多家機構構建精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)管理和共享技術平臺。
少量生命大數(shù)據(jù)的研究成果已經(jīng)進入普通百姓的視野
在媒體的大力宣傳下,大數(shù)據(jù)和精準醫(yī)療的概念已出現(xiàn)在普通百姓的生活中。一些基于生命大數(shù)據(jù)的成果已經(jīng)被用到普通消費者身上,最為常見的就是基因檢測了。
通過對具有特定特征(如患某種疾?。┑娜巳汉蛯φ杖巳哼M行遺傳物質(zhì)的對比和關聯(lián)研究,可挖掘出一些與該特征相關的基因位點。一些商業(yè)公司將同類疾病的不同研究結果綜合起來,評估消費者患某類疾病的風險。這被認為是一個很酷、有用、擁有巨大商業(yè)前景的行業(yè),因此近一兩年內(nèi)成立了許多面向普通消費者的基因檢測公司。
“十三五”期間的生命大數(shù)據(jù)
我國的精準醫(yī)療從今年開始落地實施,研究內(nèi)容涉及到大規(guī)模人群隊列研究和精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)研究??梢灶A見,在三到五年內(nèi),將會產(chǎn)生大量中國人群的各類生命大數(shù)據(jù)以及對應的知識注釋。
一方面,這些大數(shù)據(jù)將有望打破歐美國家對生命大數(shù)據(jù)的壟斷,形成世界范圍內(nèi)的新布局;同時,將有力推動我國生命科學研究和健康事業(yè);此外,階段性的成果也可能會被單獨拿出來,直接走向面對普通消費者的商業(yè)模式中(就像基因檢測一樣)。
伴隨著美好愿景的,也一定還有潛在問題:
1、我國還缺乏一個國家級的、被廣大科研人員認可的數(shù)據(jù)存儲、使用、共享平臺;
2、大數(shù)據(jù)的安全與管理也是重中之重;
3、各類公司帶著一些成果直接面向普通消費者,但缺乏統(tǒng)一、可用的行業(yè)標準,不當?shù)幕蚪庾x有可能傷害一些消費者,造成普通百姓對大數(shù)據(jù)行業(yè)的誤解。
數(shù)據(jù)分析咨詢請掃描二維碼
若不方便掃碼,搜微信號:CDAshujufenxi
LSTM 模型輸入長度選擇技巧:提升序列建模效能的關鍵? 在循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(RNN)家族中,長短期記憶網(wǎng)絡(LSTM)憑借其解決長序列 ...
2025-07-11CDA 數(shù)據(jù)分析師報考條件詳解與準備指南? ? 在數(shù)據(jù)驅(qū)動決策的時代浪潮下,CDA 數(shù)據(jù)分析師認證愈發(fā)受到矚目,成為眾多有志投身數(shù) ...
2025-07-11數(shù)據(jù)透視表中兩列相乘合計的實用指南? 在數(shù)據(jù)分析的日常工作中,數(shù)據(jù)透視表憑借其強大的數(shù)據(jù)匯總和分析功能,成為了 Excel 用戶 ...
2025-07-11尊敬的考生: 您好! 我們誠摯通知您,CDA Level I和 Level II考試大綱將于 2025年7月25日 實施重大更新。 此次更新旨在確保認 ...
2025-07-10BI 大數(shù)據(jù)分析師:連接數(shù)據(jù)與業(yè)務的價值轉(zhuǎn)化者? ? 在大數(shù)據(jù)與商業(yè)智能(Business Intelligence,簡稱 BI)深度融合的時代,BI ...
2025-07-10SQL 在預測分析中的應用:從數(shù)據(jù)查詢到趨勢預判? ? 在數(shù)據(jù)驅(qū)動決策的時代,預測分析作為挖掘數(shù)據(jù)潛在價值的核心手段,正被廣泛 ...
2025-07-10數(shù)據(jù)查詢結束后:分析師的收尾工作與價值深化? ? 在數(shù)據(jù)分析的全流程中,“query end”(查詢結束)并非工作的終點,而是將數(shù) ...
2025-07-10CDA 數(shù)據(jù)分析師考試:從報考到取證的全攻略? 在數(shù)字經(jīng)濟蓬勃發(fā)展的今天,數(shù)據(jù)分析師已成為各行業(yè)爭搶的核心人才,而 CDA(Certi ...
2025-07-09【CDA干貨】單樣本趨勢性檢驗:捕捉數(shù)據(jù)背后的時間軌跡? 在數(shù)據(jù)分析的版圖中,單樣本趨勢性檢驗如同一位耐心的偵探,專注于從單 ...
2025-07-09year_month數(shù)據(jù)類型:時間維度的精準切片? ? 在數(shù)據(jù)的世界里,時間是最不可或缺的維度之一,而year_month數(shù)據(jù)類型就像一把精準 ...
2025-07-09CDA 備考干貨:Python 在數(shù)據(jù)分析中的核心應用與實戰(zhàn)技巧? ? 在 CDA 數(shù)據(jù)分析師認證考試中,Python 作為數(shù)據(jù)處理與分析的核心 ...
2025-07-08SPSS 中的 Mann-Kendall 檢驗:數(shù)據(jù)趨勢與突變分析的有力工具? ? ? 在數(shù)據(jù)分析的廣袤領域中,準確捕捉數(shù)據(jù)的趨勢變化以及識別 ...
2025-07-08備戰(zhàn) CDA 數(shù)據(jù)分析師考試:需要多久?如何規(guī)劃? CDA(Certified Data Analyst)數(shù)據(jù)分析師認證作為國內(nèi)權威的數(shù)據(jù)分析能力認證 ...
2025-07-08LSTM 輸出不確定的成因、影響與應對策略? 長短期記憶網(wǎng)絡(LSTM)作為循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(RNN)的一種變體,憑借獨特的門控機制,在 ...
2025-07-07統(tǒng)計學方法在市場調(diào)研數(shù)據(jù)中的深度應用? 市場調(diào)研是企業(yè)洞察市場動態(tài)、了解消費者需求的重要途徑,而統(tǒng)計學方法則是市場調(diào)研數(shù) ...
2025-07-07CDA數(shù)據(jù)分析師證書考試全攻略? 在數(shù)字化浪潮席卷全球的當下,數(shù)據(jù)已成為企業(yè)決策、行業(yè)發(fā)展的核心驅(qū)動力,數(shù)據(jù)分析師也因此成為 ...
2025-07-07剖析 CDA 數(shù)據(jù)分析師考試題型:解鎖高效備考與答題策略? CDA(Certified Data Analyst)數(shù)據(jù)分析師考試作為衡量數(shù)據(jù)專業(yè)能力的 ...
2025-07-04SQL Server 字符串截取轉(zhuǎn)日期:解鎖數(shù)據(jù)處理的關鍵技能? 在數(shù)據(jù)處理與分析工作中,數(shù)據(jù)格式的規(guī)范性是保證后續(xù)分析準確性的基礎 ...
2025-07-04CDA 數(shù)據(jù)分析師視角:從數(shù)據(jù)迷霧中探尋商業(yè)真相? 在數(shù)字化浪潮席卷全球的今天,數(shù)據(jù)已成為企業(yè)決策的核心驅(qū)動力,CDA(Certifie ...
2025-07-04CDA 數(shù)據(jù)分析師:開啟數(shù)據(jù)職業(yè)發(fā)展新征程? ? 在數(shù)據(jù)成為核心生產(chǎn)要素的今天,數(shù)據(jù)分析師的職業(yè)價值愈發(fā)凸顯。CDA(Certified D ...
2025-07-03