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首頁大數(shù)據(jù)時代SPSS實例教程:無序多分類Logistic回歸
SPSS實例教程:無序多分類Logistic回歸
2020-12-08
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1、問題與數(shù)據(jù)

為了探討基因X突變與惡性腫瘤Y不同組織類型發(fā)生風(fēng)險的關(guān)系,某醫(yī)生設(shè)計了一項病例對照研究。該醫(yī)生納入所在科室一年收治的145名該惡性腫瘤患者,并從醫(yī)院體檢數(shù)據(jù)庫中隨機(jī)選擇了100名未患該腫瘤的體檢者作為對照。相關(guān)信息整理成表1:

表1 各病例組織類型與突變情況

變量賦值情況如表2:

表2 變量及變量賦值情況

2、對數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的分析

該研究中,“病例”與“對照”的關(guān)系不再是簡單的“患病”與“不患病”,而是病例分為四類(本例中包含對照組共四類),且各類別無次序關(guān)系?;蛘哒f,因變量Y不再是二分類的,而是無序多分類的。通過無序多分類的Logistic回歸分析可以將三種不同組織類型的病例分別與對照組進(jìn)行對比,分別得到基因X突變與三種腫瘤組織類型的暴露-風(fēng)險關(guān)系。

3、SPSS分析方法

A. 數(shù)據(jù)錄入SPSS

數(shù)據(jù)格式如表1所示,則首先在SPSS變量視圖(Variable View)中新建三個變量:ID代表患者編號,Y代表組織類型,X代表是否突變,賦值參考表2.

然后在數(shù)據(jù)視圖(Data View)中錄入數(shù)據(jù)。

B. 選擇Analyze → Regression → Multinomial Logistic

C. 選項設(shè)置

將變量Y選入因變量(Dependent)位置,變量X選入因子(Factors)位置。如果自變量中還有連續(xù)型變量,則需要放入?yún)f(xié)變量(Covariate)位置。由于因變量Y有多個分類,而無序多分類Logistic回歸的原理是先指定一個類別為參考類別,然后將其他類別分別與參考類別對比。故需點擊Reference Category設(shè)置參考類別(本例中作為參考類別的為對照組)。

SPSS默認(rèn)選擇因變量賦值中按升序排列后最后類別(即賦值最大者)為參考類別(即對照組),而本研究中參考類別Y賦值為0,故可以點擊First Category 或直接在Custom中輸入0,點擊Continue。

如果要分析的自變量不止一個,且要分析不同自變量之間的交互作用,則需點擊Model進(jìn)行設(shè)置,否則無需進(jìn)行設(shè)置。

Statistics、Criteria等維持默認(rèn)設(shè)置即可。點擊OK,SPSS生成分析結(jié)果。

4、結(jié)果解讀

Case Processing Summary 對數(shù)據(jù)進(jìn)行了總結(jié)。

Model Fitting Information 給出的模型擬合好壞的信息。其中-2Log Likelihood值越小越好,從結(jié)果中可以看出,加入自變量后的模型比只有常數(shù)項的模型擬合要好(27.311<80.234),似然比檢驗(Likelihood Ratio Tests)結(jié)果顯示這種模型的改善是有統(tǒng)計學(xué)意義的(P<0.001),說明自變量X的加入是有統(tǒng)計學(xué)意義的。

Likelihood Ratio Tests 與Model Fitting Information給出的信息一致,不再贅述。

Parameter Estimates表格給出了參數(shù)估計值。首先在表格的注釋a說明了此次回歸所使用的參考類別為“對照”,即數(shù)據(jù)中的對照組。表中給出了三種組織類型腫瘤分別與對照相比的自變量X的回歸系數(shù),且三個系數(shù)均有統(tǒng)計學(xué)意義。

以腺癌組為例,X=0相比于X=1,系數(shù)值Exp(B)為0.068,說明基因X未突變者患腺癌的風(fēng)險是突變者患腺癌風(fēng)險的0.068倍,將0.068取倒數(shù)即為基因X突變者患腺癌風(fēng)險是未突變者的1/0.068=14.71倍,P(Sig.)<0.001,說明差異有統(tǒng)計學(xué)意義。其他兩組系數(shù)解釋同。如果想直接得到X=1 對比 X=0的結(jié)果,可以將自變量X當(dāng)作協(xié)變量放入Covariate中,而不作為因子進(jìn)行分析?;蛘邔⒆宰兞糠催^來,如突變陽性時,X=0;突變陰性時,X=1。

5、結(jié)果匯總

基因X突變患者相比于未突變患者,其發(fā)生某惡性腫瘤類型為腺癌、鱗癌和大細(xì)胞癌的風(fēng)險分別為14.71(1/0.068,P<0.001),3.66(1/0.273,P=0.002),8.93(1/0.112,P<0.001)倍,均有統(tǒng)計學(xué)意義。

6、總結(jié)與拓展

1)SPSS結(jié)果中會給出Pseudo R-Square,即偽R方,或假R方,與普通線性回歸中衡量模型擬合好壞的R方概念類似。但由于Logistic回歸中因變量為分類變量,其計算方法與普通線性回歸中的R方不同,其值一般較小,可不予關(guān)注。

2)無序多分類Logistic回歸并非只用于病例對照研究中,只要分析時指定對照,且與指定的對照進(jìn)行比較得出的回歸結(jié)果可以說明想探究的問題即可。如在本研究中,若研究者關(guān)注的不是基因X突變對不同類別的腫瘤發(fā)生的風(fēng)險情況,而是基因X突變對三種類別腫瘤的發(fā)生風(fēng)險是否有差異,以及差異的大小,那么就不需要納入對照。

在本例分析中雖然我們可以在數(shù)值上看出基因X突變對三種類別腫瘤的發(fā)生風(fēng)險是不同的,但無法從統(tǒng)計學(xué)上進(jìn)行判斷,因為這種差異并沒有進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)檢驗。要探討這種差異,可以將參考類別選為三種類別腫瘤中的一中,如想比較腺癌和鱗癌的差異,則可選鱗癌組為對照,這樣得出的回歸系數(shù)即為基因X突變引起兩種類別腫瘤發(fā)生風(fēng)險的比值。

3)實際應(yīng)用中可能也需要調(diào)整一些混雜因素變量,若變量為分類型變量則放入因子位置,若為連續(xù)型變量則放入?yún)f(xié)變量位置,其分析和解釋與要分析的暴露變量是一致的。

4)可以把無序多分類Logistic回歸看作是多個二分類Logistic回歸的同時實現(xiàn)。

7、無序多分類Logistic回歸適用條件

1)不限于病例對照類型;

2)因變量為分類變量,分類大于兩個,且各分類之間并無次序關(guān)系。



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