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實現(xiàn)R與Hadoop聯(lián)合作業(yè)的三種方法
2016-06-07
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實現(xiàn)R與Hadoop聯(lián)合作業(yè)的三種方法

為了滿足用R語言處理pb量級數(shù)據(jù)的需求，我們需要把它和Hadoop聯(lián)合起來使用。本文的目的就是闡述實現(xiàn)二者聯(lián)合作業(yè)的不同技術。

方法一：利用Streaming APIs

Hadoop支持一些 Streaming API來將R語言中的函數(shù)傳入，并在MapReduce模式下運行這些函數(shù)。這些Streaming API可以將任意能在map-reduce模式下訪問和操作標準I/O接口的R腳本傳入Hadoop中。因此，你不需要額外開啟一些客戶端之類的東西。如下是一個例子：



方法二：使用Rhipe包

Rhipe包允許用戶在R中使用MapReduce。在使用這一方法前，要做相應的前期準備工作。R需要被安裝在Hadoop集群中的每一個數(shù)據(jù)節(jié)點上，此外每個節(jié)點還要安裝Protocol Buffers(更多資料請參考 http://wiki.apache.org/hadoop/ProtocolBuffers)，Rhipe也需要在每個節(jié)點上都可以被使用。

下面是在R中利用Rhipe應用MapReduce框架的范例：


方法三：使用RHadoop

RHadoop是Recolution Analytics下的一個開源庫，與Rhipe類似，它的功能也是在MapReduce模式下執(zhí)行R函數(shù)。后續(xù)列舉的都是該庫中的一些包。plyrmr包可以在Hadoop中對大數(shù)據(jù)集進行一些常用的數(shù)據(jù)整理操作。rmr包提供了一些讓R和Hadoop聯(lián)合作業(yè)的函數(shù)。rdfs包提供了一些函數(shù)來連接R和分布式文件系統(tǒng)(HDFS)。rhbase包中的函數(shù)則能連接R和HBase。

下面這個例子中，我們會演示如何使用rmr包中的一些函數(shù)來讓R與Hadoop聯(lián)合作業(yè)。


方法總結

總的說來，上述三種方法都能很容易地實現(xiàn)R與Hadoop的聯(lián)合作業(yè)，這樣一來R就擁有了在分布式文件系統(tǒng)(HDFS)上處理大數(shù)據(jù)的能力。但同時，這三種方法也各有利弊。

關鍵結論：

1、使用Streaming APIs最為簡單，它的安裝和設置都很方便。Rhipe和RHadoop都需要對R進行一些設置，并且也需要Hadoop集群上一些包的支持。但在執(zhí)行函數(shù)方面，Streaming APIs 需要將函數(shù)依次map和reduce，而Rhipe和RHadoop允許開發(fā)者在R函數(shù)中定義并調用MapReduce函數(shù)。

2、與Rhipe和RHadoop不同，使用Streamings APIs也不需要客戶端。

3、除此之外，我們也可以使用Apache Mahout，Apache Hive，Segue框架與其他來自Revolution Analytics的商業(yè)版R來實現(xiàn)大規(guī)模機器學習。

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