R語言連接數(shù)據(jù)庫常用的方法有2種：

1、使用R數(shù)據(jù)庫接口

連接MySQL，使用RMySQL包，使用前RMySQL包要先安裝。

library(RMySQL)

連接方式有2種：

（1）使用dbConnect
conn <- dbConnect(MySQL(), dbname = "rmysql", username="rmysql", password="rmysql", host="127.0.0.1", port=3306)

數(shù)據(jù)操作方法：

dbWriteTable(conn, "tablename", data) #寫表
dbReadTable(conn, "tablename")? #讀表
dbDisconnect(conn) #關(guān)閉連接

（2）使用sqldf包

首先要安裝sqldf包，其次調(diào)用：

>library(sqldf)

> sqldf("select * from t_data",dbname="test",drv="MySQL",user="root",password="",host="127.0.0.1",port=3306)

連接后，SQL查詢語句后面的參數(shù)均可省略，例如：

> sqldf("select * from t_data limit 0,10")

2、使用ODBC連接

在Windows下配置ODBC（開放數(shù)據(jù)庫連接），具體步驟如下：
（1）R下載RODBC包，安裝好。

（2）在http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc下載mySQL ODBC，安裝好。

（3）Windows：控制面板->管理工具->數(shù)據(jù)源（ODBC）->雙擊->添加->選中mysqlODBC driver一項
填寫：data source name 一項填入你要使用的名字，自己隨便命名，例如：mysql_data;
description一項隨意填寫，例如mydata
TCP/IP Server 填寫本機(jī)服務(wù)器IP，一般為：127.0.0.1
user 填寫你的mysql用戶名
password 填寫你的mysql密碼
然后數(shù)據(jù)庫里會出現(xiàn)你的mysql里的所有數(shù)據(jù)庫，選擇一個數(shù)據(jù)庫。
確定。

（4）打開R的界面調(diào)用數(shù)據(jù)庫：

library(RODBC);?

channel <- odbcConnect("mysql_data", uid="root", pwd="123");?

sqlTables(channel);#查看數(shù)據(jù)中的表?

data<-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的內(nèi)容，存到數(shù)據(jù)框里?