
先回憶一下之前用到的例子。
將其輸入R語(yǔ)言中:
age <- c(25, 34, 59, 60, 20) #患者年齡
type <- c(1, 2, 2, 2, 1) #糖尿病類型
status <- c("poor", "improved", "excellent", "poor", "excellent") #病情
comorbidity<- c(TRUE, FALSE, FALSE, TRUE, FALSE) #出現(xiàn)并發(fā)癥
mydata <- data.frame(age, type, status, comorbidity) #將數(shù)據(jù)框命名為mydata
查看mydata:
mydata
## age type status comorbidity
## 1 25 1 poor TRUE
## 2 34 2 improved FALSE
## 3 59 2 excellent FALSE
## 4 60 2 poor TRUE
## 5 20 1 excellent FALSE
接下來(lái)我們就以mydata為例,介紹一下如何對(duì)數(shù)據(jù)框進(jìn)行簡(jiǎn)單的操作。
了解一個(gè)數(shù)據(jù)框
多重線性回歸,一般是指有多個(gè)自變量X,只有一個(gè)因變量Y。前面我們主要是以簡(jiǎn)單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數(shù)量,在只有一個(gè)X時(shí),就稱簡(jiǎn)單線性回歸。
面對(duì)數(shù)據(jù),第一步就是要了解它有多少條記錄(或多少個(gè)case/ observation ),有多少個(gè)變量(variable)、分別是哪些。
## 獲取數(shù)據(jù)框的維度(幾行、幾列)
dim(mydata)
[1] 5 4
## 查看數(shù)據(jù)框中的所有變量名(列名)
names(mydata)
[1] "age" "type" "status" "comorbidity"
## 查看數(shù)據(jù)框的整體結(jié)構(gòu)(維度、變量名、數(shù)據(jù)類型、數(shù)據(jù)內(nèi)容)
str(mydata)
'data.frame': 5 obs. of 4 variables:
$ age : num 25 34 59 60 20
$ type : num 1 2 2 2 1
$ status : Factor w/ 3 levels "excellent","improved",..: 3 2 1 3 1
$ comorbidity: logi TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE
如何提取數(shù)據(jù)框中的行和列
多重線性回歸,一般是指有多個(gè)自變量X,只有一個(gè)因變量Y。前面我們主要是以簡(jiǎn)單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數(shù)量,在只有一個(gè)X時(shí),就稱簡(jiǎn)單線性回歸。
2種方法:
1. 數(shù)據(jù)框后加[ , ]。逗號(hào)前是行,逗號(hào)后是列。如果沒(méi)有指定是哪一行或哪一列,默認(rèn)為所有行/列。
## 提取第一行
mydata[1,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
## 提取第一列
mydata[,1]
[1] 25 34 59 60 2
## 提取某幾行或某幾列
## 提取1~3行
mydata[1:3,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
## 提取第1和第5行的1、2、4列
mydata[c(1,5),c(1,2,4)]
age type comorbidity
1 25 1 TRUE
5 20 1 FALSE
## 變量很多時(shí),用列名來(lái)提取更方便
mydata[c(1,5),c('age','type','comorbidity')]
age type comorbidity
1 25 1 TRUE
5 20 1 FALSE
2. 另一種提取列的方法是,在數(shù)據(jù)框后加 $,然后再加要提取的列名。
## 提取age這一列
mydata$age
[1] 25 34 59 60 20
獲取滿足特定條件的數(shù)據(jù)
多重線性回歸,一般是指有多個(gè)自變量X,只有一個(gè)因變量Y。前面我們主要是以簡(jiǎn)單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數(shù)量,在只有一個(gè)X時(shí),就稱簡(jiǎn)單線性回歸。
1.提取滿足某一個(gè)條件的數(shù)據(jù)。
例如,在病情status這個(gè)變量中,有poor, improved 和 excellent這三類,現(xiàn)在想獲取病情最穩(wěn)定、恢復(fù)最好的患者信息。也就是說(shuō),我們希望獲得status為excellent的病例,即選擇滿足mydata$status=='excellent'的行,以及被選中的行的每一列。
mydata[mydata$status=='excellent',]
age type status comorbidity
3 59 2 excellent FALSE
5 20 1 excellent FALSE
此外,還可進(jìn)一步提取,例如,想獲得病情status為excellent的患者中,并發(fā)癥comorbidity的情況。換句話說(shuō),就是,想提取comorbidity的信息,但這些信息必須是病情最穩(wěn)定的幾位患者的。
## 具體操作如下:先提取comorbidity,再設(shè)置status的條件
輸入語(yǔ)句:mydata$comorbidity[mydata$status=='excellent']
[1] FALSE FALSE
2.提取滿足多個(gè)條件的數(shù)據(jù)。
例如,想提取年齡age大于等于20歲,且小于35歲的病例。在R中,用&這個(gè)符號(hào)表達(dá)『并且』。用一個(gè)小豎杠 | 表達(dá)『或者』。
mydata[mydata$age>=20 & mydata$age<35,]
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
5 20 1 excellent FALSE
3.subset()函數(shù),既可用來(lái)選擇行,也可選擇列,當(dāng)然也可以用來(lái)提取滿足特定條件的內(nèi)容。
# 選擇行/滿足特定條件的行
subset(mydata, mydata$age>=20 & mydata$age<35)
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
5 20 1 excellent FALSE
# 選擇列
subset(mydata, select = c('age','status'))
age status
1 25 poor
2 34 improved
3 59 excellent
4 60 poor
5 20 excellent
有缺失數(shù)據(jù)怎么辦
多重線性回歸,一般是指有多個(gè)自變量X,只有一個(gè)因變量Y。前面我們主要是以簡(jiǎn)單線性回歸為例在介紹,兩者的差距主要在于自變量X的數(shù)量,在只有一個(gè)X時(shí),就稱簡(jiǎn)單線性回歸。
由于原來(lái)的數(shù)據(jù)框中沒(méi)有缺失數(shù)據(jù),這里我們來(lái)構(gòu)造一個(gè)新的記錄(observation),讓這個(gè)記錄中全部都是缺失值。
mydata[6,] <- NA
mydata
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
4 60 2 poor TRUE
5 20 1 excellent FALSE
6 <NA> <NA> <NA> <NA>
1. 只保留無(wú)缺失的observations。如果希望將無(wú)缺失版本的數(shù)據(jù)框保存起來(lái),要記得把na.omit(mydata)的結(jié)果賦值給新的對(duì)象。
mydata_no_NA <- na.omit(mydata)
mydata_no_NA
age type status comorbidity
1 25 1 poor TRUE
2 34 2 improved FALSE
3 59 2 excellent FALSE
4 60 2 poor TRUE
5 20 1 excellent FALSE
2. 查看哪個(gè)數(shù)據(jù)為缺失值。需要用到2個(gè)函數(shù),這里提醒大家,如果R的語(yǔ)句太復(fù)雜,那么可以先從最中心的部分讀起,一層括號(hào)一層括號(hào)地向外擴(kuò)展。
例如,下面的語(yǔ)句,可以先看最中間的is.na(mydata$age),意思是對(duì)age這列中的每個(gè)數(shù)據(jù)進(jìn)行一次檢驗(yàn),返回『是否為缺失值』的邏輯型結(jié)果,即TRUE 或者 FALSE。再看which()這個(gè)函數(shù),它返回的是前面這一串TRUE和FALSE中,出現(xiàn)TRUE的順序號(hào)。
從下面的結(jié)果我們可以看到,只有第6個(gè)數(shù)據(jù)是TRUE。
which(is.na(mydata$age))
[1] 6
is.na(mydata$age)
[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE
以上就是對(duì)數(shù)據(jù)框的一些簡(jiǎn)單操作,但是在數(shù)據(jù)處理中非常實(shí)用。下一講我們繼續(xù)介紹更多數(shù)據(jù)處理的內(nèi)容。
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